شناسایی یک سیرکوویروس کبوتری جدید در ایران

سیرکوویروس بخشی از خانواده سیرکوویریده است و شامل گونه های ویروسی با ژنومDNAتک رشتهای میشود. مشخص شده است که این ویروسها مهره-داران را آلوده میکنند، از جمله: سگ، خوک و پرندگان مانند کبوتر و اردک. در این مطالعه با استفاده از واکنش زنجیرههای پلیمراز آشیانهای سیرکوویروس کبوترPiCVدر نمونه مدفوع کبوتر تشخیص داده شد و روابط فیلوژنتیک توالی PiCVایران با سایر توالیهای موجود در ژن بانک گزارش شده است. در مجموع 50 نمونه مدفوع از مناطق متفاوت در استان چهارمحال و بختیاری ، ایران جمع آوری شد. استخراجDNAژنگانی از نمونهها با استفاده از کیت خالص سازیDNAو با توجه به دستورالعمل کارخانه سازنده انجام شد. برای تشخیصPiCVدو مجموعه پرایمر جهت تکثیرDNAویروس استفاده شد. از 50DNAاستخراج شده بعد ازPCRدر 12 مورد ( 24 درصد) قطعه مورد انتظار ازDNAیافت شد. برای اطمینان از اینکه توالی درستPiCVشناسایی شده است ، قطعاتPCRاستفاده از روش تعیین توالی سانگر توالی یابی شدند. توالیهای به دست آمده با توالیهای مرتبط در ژن بانک مقایسه شدند ، پس از آن درخت فیلوژنتیکPiCVترسیم شد. درخت فیلوژنتیک نشان دادPiCVرا می توان به سه گروه ژنتیکی متفاوت تقسیم بندی کردPiCVایران در گروه Іقرار میگیرد و نزدیک بهPiCVجدا شده از ایرلندشمالی، ایالات متحده آمریکا و چک است. این توالیها ها با توالی ویروسهای جدا شده در آسیا که در چین و تایوان یافت شده اند تفاوت قابل توجه داشتند. این مطالعه اولین گزارش از ترسیم درخت فیلوژنتیک و تشخیص مولکولیPiCVدر نمونه مدفوع کبوتر در ایران است

کلیدواژه ها:

سیرکوویروس ، کبوتر ، درخت فیلوژنتیک ، ایران