واکاوی توالی های ریبوسوئیچی در ژنهای دخیل در مرگ سلولهای انسانی و باکتریایی بر اساس داده پردازی های رایانه ای

ریبوسوئیچ ها، عناصر تنظیمی مستتر در نواحی کدگذار و غیرکدگذار ژنوم گستره بزرگی از جانداران، از باکتریها تا پستانداران میباشند. این عناصر که در تنظیم بیان ژن دخالت دارند، می توانند بعنوان اهداف دارویی مورد استفاده قرار گیرند. علیرغم قابلیت این توالیها در گسترشذخیره داروهای ضدباکتریایی، وجود احتمالی توالیهای مشابه در ژنوم انسانی منجر به ناکارآمدی این جایگاه ها بعنوان اهداف نوینضدباکتریایی شده است. لذا، آثار جانبی ناشی از وجود جایگاه های مشابه در ژنوم انسانی، از بزرگترین چالشهای مرتبط با طراحی دارو مبتنی بر ریبوسوئیچ ها می باشد؛ که خود مستلزم توجه به حضور چنین توالیهایی در ژنوم انسان است. بر این اساس، در این تحقیق واکاوی توالی های مشابه با 12 نوع ریبوسوئیچ شناخته شده در ژنهای دخیل در مرگ برنامه ریزی شده سلولهای انسانی و ژن های مرتبط با اپران هایcinA, recA, dinF, lytAباکتریایی، با استفاده از داده پردازی های رایانه ای مبتنی بر برنامه هایی چونRiboSWوBlastnدر دستور کار قرار گرفت. نتایج حاصل از این تحقیق منجربه آشکار شدن بعضی از توالیهای ریبوسوییچی در ژنهای دخیل درمرگ سلول باکتریایی و عدم حضور آنها در نواحی کد گذار ژنهای انسانی شد. به طور کلی، یافته های حاصل از این واکاوی مبین عدم حضور توالیهای شبه ریبوسوئیچی شناخته شده در نواحی کدگذار برخی از ژنهای دخیل در مرگ سلول انسانی می باشد. با این وجود، جهت استفاده از ریبوسوئیچ ها بعنوان اهداف ضدباکتریایی و طراحی داروهای نوین، واکاوی تمامی ژنوم انسانی و یا ژنهای ویژه بر علیه ریبوسوئیچ مربوطه، ضروری میباشد.

کلیدواژه ها:

ریبوسوئیچ ، تنظیم بیان ژن ، اهداف دارویی ، مرگ برنامه ریزی شده سلولی