آنالیز مولکولی توالی ژن 1Δ - پرولین- 5-کربوکسیلات سنتتاز (P5CS) در گونه های خانواده گرامینه
سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 925
فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NABATAT13_0671
تاریخ نمایه سازی: 4 آذر 1393
چکیده مقاله:
گیاهان وقتی در معرض خشکی و شوری قرار میگیرند با تنش اسمزی مواجه میشوند که برای مقابله با تنش اسمزی ایجاد شده، تجمع اسمولیتهایی همچون پرولین را افزایش میدهند. آنزیم P5CS در بیوسنتز پرولین نقش کلیدی دارد. هدف این مطالعه، بررسی تنوع اللی توالی cDNA ژن P5CS در گونه هایی از خانواده گرمینه میباشد. در این بررسی از 8 توالی cDNA ژن P5CS در گونه هایی از خانواده گرمینه که از پایگاه اطلاعات ژنتیکی NCBI استخراج شده بود، استفاده گردید. نتایج همردیفی توالیهای نوکلئوتیدی با استفاده از نرم افزار CLC Sequence Viewer 6 ، تنوع بالایی را در سطح ژن P5CS برای گونه های مورد بررسی نشان داد. نتایج همردیفی توالیهای آمینواسیدی ژن P5CS در گونه های مورد بررسی با استفاده از نرم افزار CLC Sequence Viewer 6 نیزحاکی از تنوع پروتئینی میان گونه ها میباشد. نتایج آنالیز فیلوژنتیکی توالیهای cDNA ژن P5CS با استفاده از الگوریتم UPGMA توسط نرم افزار MEGA 5 براساس توالیهای نوکلئوتیدی و آمینواسیدی، گونه ها را در 4 گروه طبقه بندی نمود. ماتریس تشابه و فاصله توالی cDNA ژن P5CS در گونه های مورد بررسی، درسطوح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی با نرم افزار MegAlign محاسبه گردید. درسطوح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی بیشترین درصد تشابه میان گونه های Oryza sativa و Oryza sativa (japonica cultivar-group) مشاهده گردید. بیشترین درصد تفاوت در سطح نوکلئوتیدی میان گونه های Sorghum bicolor و Lolium perenne و در سطح آمینواسیدی میان گونه های Sorghum bicolor و Puccinellia chinampoensis مشاهده گردید.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سمیرا محمدی
دانش آموخته کارشناسی ارشد اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام
علی اشرف مهرابی
استادیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام
زینب سهرابی زاده
استادیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام