کاربرد آنالیز ژن 16s rRNAدر شناسایی باکتری های لومینسانس حوضچه های پرورش میگو خلیج فارس

در مورد تعداد و تنوع گونه های مورد هدف می باشد. در این تحقیقعلاوه بر رو شهای متداول م کیروبیولوژی از ژن 16S rRNA بعنوان کیابزار سریع و دقیق برای شناسایی باکتری های لومینسانس جداشده ازحوضچه های پرورش میگو در خلیج فارس استفاده گردیدمواد و رو شها: نمونه برداری از دو مزرعه ) 9 استخر( پرورش میگو دراستان بوشهر انجام شد. جداسازی و خالص سازی آنها بااستفاده از محیطکشت های ) TCBS و SWC ( و با 7.2=pH انجام و. لومینسانس آنهاتوسط دستگاه بیولومینومتر اندازه گیری گردید. DNA کلنی هایی کهبیشترین شدت نور را داشتند استخراج گردید و توالی ژن 16S rRNAتع یین و با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیک با داده های موجودمقایسه گردید.نتایج: برطبق آنالیز 16S rRNA ، میزان تطابق توالی های ژن مزبور در ایزولههای 1A، 1B و 2B ، به ترتیب با باکتری های ، Vibrio alginolyticusVibrio owensii و %99 Vibrio communis همخوانی نشان داد.بحث: نتایج BLAST نشان می دهد که هرسه نمونه متعلق به خانوادهگونه Vibrio harveyi هستند. از طرفی دو نمونه 1B و 2B مشابه بودهو تفاوتی با کیدیگر نمی کنند و باعضو دیگر خانواده Vibrio harveyi یعنی Vibrio communis تشابه دارند. نتیجه BLAST نمونه 1A ، آنرا مشابه گونه Vibrio alginolyticus نشان می دهد اما همین گونهنزد کیی زیادی با گونه مادری یعنی Vibrio harveyi دارد.نتیجه گیری: گونه Vibrio harveyi به عنوان کی گونه اجدادی برایچندین گونه محسوب می شود که از نظر توالی 16s rRNA تا حدی ازکیدیگر جداشده اند و تفاوت نوکلئوتیدی پیدا کرده اند. اما برای جداییگونه های تازه جداشده از گونه مادری Vibrio harveyi زمان تکاملیبیشتری مورد نیاز است.