پیش بینی متغییرهای ژنی آنزیم امگا-3 فتی اسید دیسچوراز براساس مدل های بیوانفورماتیک

اسیدهای چرب غیر اشباع براساس موقعیت اولین پیوند دوگانه شان به امگا-3، 6 و 9 تقسیم بندی می شوند. هدف این تحقیق پیدا کردن مهم ترین مولفه های ژنی اختصاصی ارگانیزمی آنزیم امگا-3 فتی اسید دیسچوراز (FAD8) با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی و طراحی مدل های پیش بینی (برای اولین بار) جهت تعیین ارگانیزمهای این آنزیم ها می باشد. روش کار توسط ابزار های متفاوت بیوانفورماتیکی که تعداد 43 مشخصه ی ژنی را از نظر تعداد، تکرار نوکلئوتیدها و عناصر متفاوت ژن ها مورد محاسبه قرارمی دهند. همچنین توسط برنامه Rapidminer درخت های تصمیم گیری و دسته بندی متغیرهای ژنی استخراج می کند. براساس نتیجه مهم ترین متغیر ژنی در تشخیص ساختارهای ارگانیزمی آنزیم FAD8 فراوانی هیدروژن بوده است. مدل های پیش بینی طراحی شده نشان دادند که مدلNeural Network با معیار Relief با دقت 84.67% می تواند ارگانیزم آنزیم های جدید را براساس خصوصیات ژنی پیش بینی نماید. دو یافته فوق برای اولین بار در این مطالعه گزارش می شوند.

کلیدواژه ها:

3امگا ، FAD8 ، Omega-3 fatty acid desaturase