پیشگویی نوع تومور ریوی با استفاده از مدل های SVM بر اساس خصوصیات ساختاری و فیزیکوشیمیایی پروتئین های درگیر

سرطان ریه یکی از بیماری هایی است که تشخیص آن بسیار سخت است. میزان بقای این نوع سرطان حدود 15٪ است. به منظور بهبود نرخ بقا، مانیاز به روش تشخیصی سریع برای تمایز بین تومورهای ریوی با یاخته های کوچک (SCLC) از تومورهای ریوی با یاخته های بزرگ(NSCLC) داریم، زیر ا بیماران مبتلا بهNSCLC متفاوت از کسانی است که مبتلا به تومور SCLC هستند، درمان می شوند. در این مطالعه ،ما یک سیستم معتبر تشخیصی براساس خصوصیات ساختاری و فیزیکی مشتق شده از توالی پروتئین های درگیر در هر نوع از تومورهای ریه، پیشنهاد می کنیم. این سیستم معتبر دارای دو مرحله است. 1. استخراج داده ها و انتخاب خصوصیات مهم. 2. طبقه بندی و پیش بینی. در مرحله ی استخراج داده ها، پروتئین هایی که در هر نوع از تومورهای ریه درگیر هستند با استفاده از ژن های تعریف شده توسط تجزیه و تحلیل های میکرواری به دست آمدند و 1497 خصوصی ت این پروتئین هاتوسط سرور PROFEAT محاسبه شد. سپس ویژگی های مهم مانند همبستگی، ترکیب دی پپتیذها و توصیفگر توزیع با استفاده از21 مدل وزن دهی انتخاب شدند. در مرحله دوم، هفت مدلSVM بر روی FCdb و مجموعه داده های به دست آمده از مدل های وزن دهی پیاده شد. علاوه بر این، دو مدل اعتبارسنجی برای جلوگیری از خطاها استفاده شده است. نتایج پروسه ی ما نشان داد که دقت پیش بینی نوع تومور ریوی (NSCL ،SCLC یا مشترک) حدود 76/18 درصد به دست آمد.