غربالگری، جداسازی و ارزیابی استرپتومایسس تولید کننده ی مواد ضد میکروبی از پارک ملی کویر، ایران

میکروارگانیسم های خاک، به ویژه گونه های استرپتومایسس، منبع غنی ترکیبات ضدمیکروبی طبیعی هستند. این پژوهش با هدف غربالگری، جداسازی و شناسایی مولکولی سویه های استرپتومایسس تولیدکننده مواد ضدمیکروبی از پارک ملی کویر، ایران، با هدف تحقیق شناسایی و جداسازی سویه های استرپتومایسس از نمونه های خاک پارک ملی کویر و ارزیابی توانایی آن ها در تولید ترکیبات ضدمیکروبی، با تمرکز بر شناسایی دقیق مولکولی انجام شد. نمونه های خاک از مناطق مختلف پارک ملی کویر جمع آوری گردید. سویه های استرپتومایسس با استفاده از محیط های کشت انتخابی جداسازی شدند. فعالیت ضدمیکروبی سویه های جدا شده علیه باکتری های پاتوژن با روش انتشار دیسک ارزیابی شد. سویه R۱ که پتانسیل ضدمیکروبی قابل توجهی نشان داد، برای شناسایی مولکولی انتخاب شد. شناسایی این سویه با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) با هدف تکثیر ژن ۱۶S rRNA انجام گرفت. از پرایمرهای عمومی برای تکثیر ناحیه حدود ۱۵۰۰ جفت باز و از پرایمرهای اختصاصی RmF/RmR برای تکثیر قطعه ای به طول تقریبی ۵۰۰ جفت باز استفاده شد. نتایج حاصل از PCR به همراه تحلیل های فیلوژنتیکی مورد ارزیابی قرار گرفتند. در مجموع تعداد ۴ سویه استرپتومایسس از پارک ملی کویر جداسازی گردید. سویه R۱ بیشترین فعالیت ضدمیکروبی را علیه سویه های آزمایشی نشان داد. نتایج PCR و تحلیل های فیلوژنتیکی تایید کردند که سویه R۱ به گونه Bacillus subtilis تعلق دارد. سویه R۱ که از پارک ملی کویر جداسازی شده بود، پس از شناسایی مولکولی، به عنوان Bacillus subtilis تعیین گردید این یافته ها نشان دهنده پتانسیل پارک ملی کویر به عنوان منبعی برای کشف میکروارگانیسم های مفید و کاربردی است.

کلیدواژه ها:

استرپتومایسس ، مواد ضدمیکروبی ، پارک ملی کویر ، غربالگری ، شناسایی مولکولی ، ژن ۱۶S rRNA