تلفیق ارزیابی فنوتیپی و تحلیل ژنومی بر پایه نشانگر SNP برای شناسایی ژنوتیپ های گندم متحمل به تنش کم آبی

سال انتشار: 1405
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 7

فایل این مقاله در 30 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-18-4_007

تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1405

چکیده مقاله:

هدف: خشکی از تنش های غیر زیستی است که موجب کاهش عملکرد در محصولات کشاورزی به ویژه گندم، در نواحی خشک و نیمه خشک جهان می شود. ارزیابی صفات زراعی و فیزیولوژیک در شرایط تنش کم آبی برای شناسایی صفات تاثیر گذار بر عملکرد دانه و شناسایی ژنوتیپ های متحمل به خشکی برای استفاده در برنامه های به نژادی مفید است.مواد و روش ها: در این مطالعه به منظور ارزیابی پتانسیل عملکرد دانه و انتخاب ژنوتیپ های متحمل به تنش کم آبی، ۲۵۵ ژنوتیپ گندم نان در قالب طرح بلوک های کامل تصادفی با دو تکرار در شرایط نرمال و تنش کم آبی در مزرعه تحقیقاتی پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی دانشگاه شهید باهنر کرمان مورد ارزیابی قرار گرفتند همچنین ژنوتیپ یابی با استفاده از آرایه چندشکلی تک نوکلئوتیدی (SNP) با تراکم k۹۰ در موسسه IPK آلمان انجام شد. برای تجزیه داده ها از روش های آماری شامل تجزیه واریانس مرکب، همبستگی، رگرسیون گام به گام و تجزیه علیت استفاده شد و همچنین شاخص های تحمل به تنش و ارزش های اصلاحی ژنومی (GEBV) برآورد گردید.نتایج: نتایج تجزیه واریانس مرکب تفاوت معنی داری بین ژنوتیپ ها، محیط و اثر متقابل ژنوتیپ × محیط برای اکثر صفات نشان داد. اکثر صفات مرتبط با اجزای عملکرد، همبستگی مثبتی با عملکرد دانه نشان دادند. بر اساس نتایج تجزیه رگرسیون و تجزیه علیت، صفات تعداد دانه در واحد سطح و وزن هزار دانه تاثیر عمده ای بر عملکرد دانه داشتند. همچنین، دقت پیش بینی ارزش های اصلاحی ژنومی در محدوده ۵۶/۰تا ۸۲/۰ و وراثت پذیری خصوصی بین ۰۹/۰ تا ۴۲/۰ برآورد شد که بیانگر کارآیی مناسب انتخاب ژنومی در شرایط تنش کم آبی است. مقایسه رتبه بندی ژنوتیپ ها بر اساس شاخص STS وGEBV نشان داد که بین دو روش همبستگی مثبت و معنی داری وجود دارد (۷۰۵/۰=ρ ، ۰۰۱/۰P <) و برخی ژنوتیپ ها، از جمله ۴۰، ۵۳ و ۱۳۲، در هر دو روش در بین ژنوتیپ های برتر قرار گرفتند.نتیجه گیری: در مجموع، صفات تعداد دانه در واحد سطح، وزن هزار دانه و وزن دانه در بوته به عنوان مهم ترین صفات موثر بر عملکرد دانه در شرایط تنش شناسایی شدند. همچنین نتایج این پژوهش نشان داد که انتخاب ژنومی و شاخصSTS، با وجود تفاوت در مبنای ارزیابی، اطلاعات مکملی در شناسایی ژنوتیپ های متحمل به تنش کم آبی ارائه می کنند و استفاده تلفیقی از آن ها می تواند دقت انتخاب را در برنامه های اصلاحی افزایش دهد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

ملیحه رحیمی صادق

گروه مهندسی تولید وژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران.

سمیه ساردویی نسب

پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی، پژوهشگاه افضلی پور، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران

مریم دورانی نژاد

گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران.

سودابه گلستانی کرمانی

استادیار، بخش مهندسی آب، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران

شکوفه خاندانی

گروه ژنتیک و به نژادی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

ماجد عبوده

گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، ایران

محسن دشر

بخش علوم خاک و منابع آب، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بصره، عراق

قاسم محمدی نژاد

پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی، پژوهشگاه افضلی پور، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران

آندرس بورنر

بخش بانک ژن، موسسه لایبنیتس تحقیقات ژنتیک گیاهی و گیاهان زراعی (IPK)، گاترسلبن، آلمان

احمد القضاه

گروه علوم زیستی و علوم محیطی، دانشکده هنرها و علوم، دانشگاه قطر، دوحه، قطر

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • احمدی لاهیجانی محمدجواد، امام یحیی (۱۳۹۲). بررسی واکنش ژنوتیپ های ...
  • حسین زاده عبدالهادی, خضری عفراوی منصور, میری سید تراب، پیغمبری ...
  • حمزه حمزه, صبا جلال, جابری فرهاد, نصیری جابر، علوی حسینی ...
  • خدادادی مصطفوی, دهقانی حمید, فتوکیان محمد حسین(۱۳۹۰) بررسی توارث پذیری، ...
  • خضری عفراوی منصور, حسین زاده عبد الهادی, محمدی ولی اله، ...
  • دهقان عبدالرزاق, خدارحمی منوچهر، مجیدی هروان اسلام (۱۳۹۰) تنوع ژنتیکی ...
  • سلیمانی فرد عباس و ناصری رحیم (۱۳۹۹) بررسی روابط بین ...
  • ارزیابی تنوع و شناسایی صفات موثر بر عملکرد لاین های امیدبخش گندم نان تحت تنش شوری [مقاله ژورنالی]
  • صادقی کاوه, پهلوانی محمدهادی, اسماعیل زاده مقدم محسن، زینلی نژاد ...
  • صادق زاده اهری داود (۱۳۸۵) ارزیابی تحمل به تنش خشکی ...
  • قربانی مندولکانی حسین, خدارحمی منوچهر, درویش فرخ، تائب محمد (۱۳۸۹) ...
  • ارزیابی تحمل به خشکی در برخی از ژنوتیپ های گندم با استفاده از شاخص های تحمل به تنش خشکی [مقاله ژورنالی]
  • ناصری رحیم, براری مهرشاد, زارع محمدجواد, خاوازی کاظم, طهماسبی زهرا ...
  • Abdoli, M., & Saeidi, M. (۲۰۱۲). Effects of water deficiency ...
  • Ahmadi Lahijani, M. J., & Emam, Y. (۲۰۱۳). Response of ...
  • Amiri, R., Bahraminejad, S., & Sasani, S. (۲۰۱۳). Evaluation of ...
  • Bouslama, M., & Schapaugh Jr, W. T. (۱۹۸۴). Stress tolerance ...
  • Crossa, J., Pérez-Rodríguez, P., Cuevas, J., Montesinos-López, O., Jarquín, D., ...
  • Daetwyler, H. D., Villanueva, B., & Woolliams, J. A. (۲۰۰۸). ...
  • Dawari, N. H., & Luthra, O. P. (۱۹۹۱). Character association ...
  • Dehghan, A., Khodarahmi, M., & Majidi, E. (۲۰۱۱). Genetic variation ...
  • Endelman, J.B. (۲۰۱۱). Ridge regression and other kernels for genomic ...
  • Fernandez, G. C. (۱۹۹۲). Effective selection criteria for assessing plant ...
  • Fischer, R. A. (۲۰۱۱). Wheat physiology: a review of recent ...
  • Fischer, R. A., & Maurer, R. (۱۹۷۸). Drought resistance in ...
  • Gavuzzi, P., Rizza, F., Palumbo, M., Campanile, R. G., Ricciardi, ...
  • Ghorbani Mandolakani, H., Khodarahmi, M., Darvish, F., & Taeb, M. ...
  • Guzman, Carlos, Roberto Javier Peña, Ravi Singh, Enrique Autrique, Susanne ...
  • Haile, J. K., N’Diaye, A., Clarke, F., Clarke, J., Knox, ...
  • Hamzeh, H., Saba, J., Jabari, F., Nassiri, J., & Alavi ...
  • Herter, C. P., Ebmeyer, E., Kollers, S., Korzun, V., & ...
  • Hoseinzadeh, A. H., Khezri-Afrawi, M., Miri, T., & Peyghambari, A. ...
  • Islam, M. A., Raffi, S. A., Hossain, M. A., & ...
  • Kamrani, M., Farzi, A., & Shiri, M., (۲۰۱۷). Evaluation of ...
  • Kashif, M., & Khaliq I., (۲۰۰۴). Heritability, correlation and path ...
  • Khodadadi, M., Dehghani, H., & Fotokian, M. H. )۲۰۱۱(. Study ...
  • Kondwakwenda, A., Sibiya, J., Zengeni, R., & Musvosvi, C. (۲۰۲۱). ...
  • Mardeh, A. S. S., Ahmadi, A., Poustini, K., & Mohammadi, ...
  • Meuwissen, T. H., Hayes, B. J., & Goddard, M. (۲۰۰۱). ...
  • Moosavi, S. S. , Yazdi Samadi, B. , Naghavi, M. ...
  • Naseri, R., Barari, M., Zarea, M. J., Khavazi, K., & ...
  • Poland, J. A., & Rife, T. W. (۲۰۱۲). Genotyping‐by‐sequencing for ...
  • Rahman, M. A., Chikushi, J., Yoshida, S., & Karim, A. ...
  • Rakshit, S., Ganapathy, K. N., Gomashe, S. S., Rathore, A., ...
  • Reynolds, M., Bonnett, D., Chapman, S. C., Furbank, R. T., ...
  • Rosielle, A. A., & Hamblin, J. )۱۹۸۱(. Theoretical aspects of ...
  • Saberi, M. H., Arazmjoo, E., & Amini, A. )۲۰۱۷(. Assessment ...
  • Sadeghzadeh A. D.)۲۰۰۶(. Evaluation for tolerance to drought stress in ...
  • Schneider, K.A., Rosales‐Serna, R., Ibarra‐Perez, F., Cazares‐Enriquez, B., Acosta‐Gallegos, J.A., ...
  • Tabatabai, S. M. T., Solouki, M., Fakhery, B., Esmailzadeh-Moghaddam, M., ...
  • Vivek BS, Krishna GK, Vengadessan V, Babu R, Zaidi PH, ...
  • Wei, T., Simko, V., Levy, M., Xie, Y., Jin, Y., ...
  • نمایش کامل مراجع