بررسی روابط خویشاوندی دو گونه دیدیملا D. microchlamydospora و Didymella glomerata از عوامل سرخشکیدگی مرکبات

در سال های اخیر بیماری های شانکر و مرگ سرشاخه یکی از مشکلات عمده مرکبات ایران خصوصا در مناطق جنوب کشور شده و بسیاری از باغات مرکبات در اثر این بیماری از بین رفته است. عوامل زیادی در بروز این علایم نقش دارند که از میان این عوامل قارچ ها و شبه قارچ ها بیشترین نقش را در ایجاد این بیماری در مرکبات دارند. دو قارچ Didymella glomerata CBS و D. microchlamydospora CBS در این تحقیق به عنوان یکی از عوامل این بیماری شناسایی شدند. این قارچ قبلا در جنس فوما قرار داشت و اخیرا به جنس دیدیملا منتقل شده است. گونه های بسیار زیادی برای جنس فوما توصیف شده است که همچنین معدود بودن خصوصیات میکرومورفولوژیک و تنوع بالای خصوصیات مورفولوژیک در محیط کشت شناسایی این قارچ ها را صرفا از طریق خصوصیات مورفولوژیک با مشکل مواجه کرده است و در واقع خصوصیات مورفولوژیک به تنهایی نمی توانند تفکیک کننده تاکسون ها باشند. بنابراین شناسایی دقیق این قارچ ها علاوه بر بررسی خصوصیات مورفولوژیک نیاز به بررسی دقیق روابط فیلوژنتیک آن ها دارد که ضرورت انجام این تحقیق را نشان می دهد. بنابراین در این تحقیق به بررسی دقیق روابط خویشاوندی قارچ های مورد بررسی پرداخته شد. برای بررسی روابط فیلوژنی پس از تکثیر و تعیین توالی ژن های مختلف (ITS, RPB۲, LSU) از روش های مختلف پارسیمونی و بیزین برای بررسی روابط فیلوژنتیک آن ها استفاده شد. این توالی ها به صورت تک ژنی و ترکیب هر چهار ژن هم ر دیف سازی شدند. آنالیز فیلوژنتیک به روش ماکزیمم-پارسیمونی و بیزین برای هر یک از ژن ها به تنهایی و همچنین ترکیب چهار ژن انجام شد. در این آنالیزها از توالی ۳۶ تاکسون استفاده شد. قارچ Epicoccum brasiliense CBS از خانواده Didymellaceae به عنوان برون گروه در نظر گرفته شد. در این آنالیز جدایه Didymella glomerata CBS با احتمال پسین ۱ و بوت استرپ ۹۸ با قارچ مشابه در یک شاخه قرار گرفتند و همچنین D. microchlamydospora CBS با احتمال پسین ۱ و بوت استرپ ۱۰۰ با قارچ مشابه در یک شاخه قرار گرفتند.

کلیدواژه ها:

سرخشکیدگی ، فیلوژنی ، ژن ، D. microchlamydospora ، D. glomerata