بررسی ترانسکریپتومی سندرم آسیت در جوجه های گوشتی

آنالیز ترنسکریپتوم (RNA-seq) ابزاری قدرتمند برای شناسایی مکانیسم های مولکولی سندرم آسیت در جوجه های گوشتی است. در یک پژوهش ترکیب RNA-seq و متابولومیکس در جوجه های مقاوم و حساس تحت تنش سرمایی نشان داد که در روز ۲۱ پرورش ۴۱۳ ژن و در روز ۳۵ ۲۱۴ ژن بیان متفاوت داشتند. ژن های با افزایش بیان در مسیرهایی نظیر انتقال اکسیژن، پاسخ های دفاعی و اصلاحات پروتئینی و ژن های با کاهش بیان در فرآیندهایی مانند مورفوژنز سلولی و سیگنال دهی B-TGF غنی سازی شدند. علاوه بر این ژن های مرتبط با هموگلوبین از جمله HBAD، HBAA، HBZ و پروتئین انتقال گاز RhAG در پرندگان مقاوم کاهش بیان داشتند. در یک پژوهش بر پایه RNA-seq و شناسایی واریانت های تک نوکلئوتیدی، بافت شریان ریوی جوجه های نژاد Arbor Acres بررسی شد. در گروه مبتلا که تحت تنش سرمایی و مصرف آب شور قرار داشتند، تغییرات پاتولوژیک قابل توجهی در دیواره شریان و عضله قلب مشاهده شد. با استفاده از RNA-seq، ۸۹۵ ژن با بیان متفاوت شناسایی شد و همپوشانی آن با داده های SNP ژن های کلیدی نظیر DHX۵۸، IGSF۱، GGT۵، IRGI، ALDHAI و CD۳۴ را آشکار ساخت که در فرآیندهای التهاب، استرس اکسیداتیو و بازسازی دیواره رگ نقش دارند. در پژوهشی دیگر بر روی ریه همان نژاد ۱۴۴۲ ژن دارای بیان متفاوت شناسایی شد که در مسیرهای ۱-p۵۳، NF-KB، HIF و CAMS و همچنین متابولیسم اسیدهای آمینه غنی سازی شدند. ژن هایی از جمله WNT۵A، TLR۴، HMOXI، APLNR، FABP۴ و CDK۶ به عنوان نامزدهای کلیدی در پاسخ به هیپوکسی، التهاب و بازآرایی عروقی معرفی شدند.

کلیدواژه ها:

بیان ، ژن ، سندرم ، آسیت ، ارتباط ژنومی ، جوجه گوشتی