توالی یابی نسل جدید و کاربرد آن در مطالعه میکروبیوم در خاک های مهارکننده بیماری های گیاهی
محل انتشار: مجله ایمنی زیستی، دوره: 14، شماره: 1
سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 121
فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_OFBIO-14-1_001
تاریخ نمایه سازی: 16 اسفند 1404
چکیده مقاله:
پیشرفت در تعیین توالی نسل جدید نقش به سزایی در مطالعات مربوط به اکولوژی جمعیت های میکروبی داشته است. این پیشرفت ها منجر به توسعه سریع در تحقیقات متاژنومیکس (تحلیل دی.ان.ای جمعیت های میکروبی بدون نیاز به کشت) شده است. بسیاری از ابزارهای آماری و محاسباتی و پایگاه های اطلاعاتی متاژنومیکس منجر به کشف حجم عظیمی از داده ها شده است. در این تحقیق علاوه بر مرور روش تعیین توالی نسل جدید، ابزارها و روش های بیوانفورماتیک مورد استفاده، موارد مطالعه شده درباره میکروبیوم خاک های بازدارنده و دست ورزی میکروبیوم جهت مقابله با بیماری های گیاهی ارائه و مورد بحث قرار می گیرند. خاک بازدارنده به خاکی گفته می شود که در آنها با وجود حضور عوامل بیمارگر شناخته شده، شیوع بیماری های گیاهی بسیار کمتر است. توجه به ساختار و شناسایی دقیق میکروبیوم این خاک ها بسیار مورد علاقه طرفداران کاهش مصرف سموم شیمیایی است.
کلیدواژه ها:
Metagenome ، Biocontrol ، Rhizosphere ، Microbiome ، NGS. ، متاژنوم ، خاک های مهارکننده ، ریزوسفر ، میکروبیوم ، NGS
نویسندگان
سکینه عباسی
Department of Plant Pathology, Faculty of Agriculture, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran.
ناصر صفایی
Department of Plant Pathology, Faculty of Agriculture, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran.
اکرم صادقی
Department of Microbial Biotechnology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran.
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
