کاوش پاسخ های دفاعی گیاه به بیمارگرها به کمک فناوری RNA-seq
محل انتشار: مجله ایمنی زیستی، دوره: 13، شماره: 1
سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 56
فایل این مقاله در 24 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_OFBIO-13-1_005
تاریخ نمایه سازی: 16 اسفند 1404
چکیده مقاله:
گیاهان برخلاف جانوران، سلول های دفاعی متحرک نداشته و سیستم دفاعی آنها به طور طبیعی قابلیت توسعه و سازگاری در برابر بیمارگرها را ندارد. سیستم ایمنی ذاتی گیاهان بسیار پیچیده و در دو لایه مهم سازمان یافته و به سیستم پیام رسانی گسترده وابسته است. هر لایه از این سیستم از اجزاء متعددی تشکیل شده که هر یک در زمان مناسب وارد عمل می شوند. سدهای دفاعی شیمیایی و فیزیکی که از ورود بیمارگر و بروز آلودگی جلوگیری می کنند، انفجار اکسیژنی، بیان پروتئین های مرتبط با بیماریزایی و مرگ سلولی برنامه ریزی شده، همه بخش هایی از این سیستم پیچیده هستند. یکی از بهترین راه های مطالعه پاسخ های دفاعی گیاه به بیمارگر مطالعه الگوی تغییرات بیان ژن در گیاه بیمار نسبت به گیاه سالم در سطح ترانسکریپتوم است. با توالی یابی مولکول های mRNA در سلول و شناسایی ژن های مربوط به این مولکول ها می توان به الگوی تغییرات بیان ژن ها و میزان این تغییرات پس از بروز بیماری پی برد. فناوری پربرونداد (High-Through put Technologies) RNA-seq با بهره گیری از توانمندی های توالی یابی نسل دوم، امکان شناسایی و کمی سازی صدها ژن را در ترانسکریپتوم فراهم می کند. این فناوری امروزه به عنوان یکی از بهترین ابزارهای مطالعه ترانسکریپتوم برهمکنشی میزبان-بیمارگر و شناسایی ژن های درگیر در پاسخ های دفاعی گیاهان شناخته می شود.
کلیدواژه ها:
Plant Immune System ، Plant/Pathogen Interaction ، RNA-seq ، Paired end Reads ، DEG Analysis. ، سیستم ایمنی گیاه ، برهمکنش گیاه/ بیمارگر ، توالی یابی آر.ان.ا ، خوانش های دوطرفه ، آنالیز ژن های دارای بیان افتراقی
نویسندگان
فاطمه خلقتی بناء
PhD in Plant Pathology, Iranian Research Institute of Plant Protection, Plant Protection Lab, Agricultural Research Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran.
احمد سبحانی نجف آبادی
PhD in Biotechnology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran.
کبری مسلم خانی
Associate Professor, Seed and Plant Registration and Certification Institute (SPCRI), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
