تحلیل بیوانفورماتیکی شبکه ژنی و مسیرهای زیستی مرتبط با بیماری لکه سفید (WSD) در میگوی سفید غربی (Litopenaeus vannamei )
سال انتشار: 1404
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 17
فایل این مقاله در 22 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JAPB-13-3_002
تاریخ نمایه سازی: 11 بهمن 1404
چکیده مقاله:
ویروس سندروم لکه سفید (WSSV) عامل بیماری لکه سفید (WSD) است که طی دههای اخیر موجب ضررهای اقتصادی زیادی در صنعت جهانی پرورش میگو شده است. هدف از این پژوهش، شناسایی مسیرهای زیستی موثر و ژنهای کلیدی مرتبط با بیماری لکه سفید در میگوی سفید غربی (Litopenaeus vannamei) بود. داده های ریز آرایه شامل ۶ نمونه از بافت هپاتوپانکراس میگوهای سالم و ۶ نمونه از بافت هپاتوپانکراس میگوهای آلوده به WSSV از پایگاه داده GEO با شماره دسترسی GSE۴۹۵۵ استخراج و با استفاده از ابزار GEO۲R تجزیه و تحلیل شدند. سپس ژن های افتراقی با بیان معنیدار مشخص شدند. از نرم افزار آنلاین STRING به منظور ساخت شبکه بین ژن های افتراقی استفاده شد. سپس ژنهای کلیدی با استفاده از افزونه CytoHubba در نرم افزار Cytoscape و با روش حداکثر مرکزیت دسته (MCC) شناسایی شدند. عملکرد پیشبینی شده ژنهای کلیدی در ارتباط با بیوسنتز پروستاگلاندین، فاکتور هستهای کاپا B (NFKB)، پروتئین کیناز فعال شده با میتوژن (MAPK) و گیرنده گاما فعال شده با تکثیر پراکسیزوم (PPARG) بود. به نظر میرسد مسیرهای زیستی مربوط به این ژنها به ویژه ژنهای NFKB و MAPK میتوانند برای شناسایی نشانگرهای زیستی مرتبط با بیماری لکه سفید، تشخیص و یا طراحی مهارکننده علیه آن بیماری مفید باشند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
رضا پسندیده
استادیار پژوهشکده میگوی کشور، موسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، بوشهر، ایران
مجید پسندیده
استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :