بررسی بیان ژنی تنظیم کننده های کلیدی تشکیل لایه های زاینده در جنین های جوجه با استفاده از تکنیک RT-PCR

هدف: مطالعات مختلف نشان داده اند که ژن PRDM۱۴ نقش بسیار مهم و بنیادی در رشد اولیه جنین جوجه و تشکیل لایه های زاینده دارد. هدف این مطالعه بررسی الگوی بیان ژن PRDM۱۴ در مراحل اولیه تکوین جنینی و همچنین بررسی نقش تکاملی آن بود. این پژوهش همچنین به دنبال ساده سازی شناسایی خانواده های اصلی فاکتورهای رونویسی فعال در پنج روز نخست رشد جنینی است.مواد و روش ها: برای مقایسه PRDM۱۴ با سایر اعضای خانواده PRDM، از تحلیل فیلوژنتیک استفاده شد. همچنین، پروفایل گذاری مقایسه ای بیان ژن برای بررسی فعالیت ژنی در مراحل E۱ تا E۵ انجام شد که نمایانگر اولین و حساس ترین مراحل رشد جنین جوجه هستند. از مجموعه داده های عمومی ژنومی و خانواده های ژنی حاشیه نویسی شده برای شناسایی فاکتورهای رونویسی و تعیین توزیع آن ها در سراسر ژنوم استفاده شد.نتایج: تحلیل ها نشان داد که ژن PRDM۱۴ و سایر ژن های خانواده PRDM الگوی واگرایی تکاملی مشابهی با سایر مهره داران دارند. مراحل E۱ تا E۵ به عنوان حیاتی ترین مراحل تکوین جنینی شناسایی شدند و تغییرات عمده ای در بیان ژن در این دوره ها مشاهده شد. در بین جنین های بررسی شده، ۱۰۹۷ فاکتور رونویسی شناسایی شد. این ژن ها دارای توزیع تصادفی نبودند، بلکه الگوی ساختاری ژنومی معناداری داشتند. خانواده های فاکتور رونویسی مانند bHLH، Zf-C۲H۲ و Homeobox نیز شناسایی شدند که نقش مهمی در رشد اولیه دارند. پروتئین های هومئوباکس از ۶۰ اسید آمینه تشکیل شده اند و برای تنظیم بسیاری از فرآیندهای تکوینی ضروری هستند. فاکتورهای رونویسی ISL۱، MKX، NANOG و CDX۲ شناسایی و در گروه های Homeobox و bHLH طبقه بندی شدند. این فاکتورها در تعیین سرنوشت سلولی، تشکیل دودمان های سوماتیک و پلوری پوتنسی نقش دارند. در روزهای ۴ و ۵، گروه bHLH بیان بالایی نشان داد که نقش اساسی در تکوین دستگاه عصبی و سلول های زایشی دارد.نتیجه گیری: این مطالعه نشان می دهد که مراحل اولیه تکوین جنینی شامل فعالیت هماهنگ خانواده های اصلی فاکتورهای رونویسی است. الگوی بیان ساختاریافته و فعال سازی زودهنگام PRDM۱۴ نشان دهنده نقش اساسی آن در هدایت هویت سلولی و مسیرهای تکوینی در جنین های جوجه است.

کلیدواژه ها:

تکوین جنینی ، جنین جوجه ، سلول های زایشی ، هومئوباکس ، PRDM۱۴