بررسی اثردما برپروتئین پریون به کمک شبیه سازی دینامیک مولکولی

بیماریهای پریونی گروهی ازبیماریهای کشنده هستند که درآنها دستگاه عصبی تحلیل میرود و ظاهرمغز حفره دارمیشود و به مرگ بیمار منجر میشوند تا مدت ها عامل این بیماری مشخص نبود اما امروزه طبق یک فرضیه پروتئین تنها پروتئین پریون غیرطبیعی یا PrPsc را عامل این بیماری میدانند این پروتئین موجب تبدیل پروتئین پریون طبیعی و PrPc به حالت بیماریزای آن یعنی PrPsc میشود علیرغم انجام تحقیقات فراوان درخصوص فرایند غیرطبیعی شدن پریون طبیعی و عوامل درگیر دراین تبدیل ناشناخته های این فرایند بسیار زیاد است دراین پژوهش تاثیر دما براین پروتئین مورد مطالعه قرارداده شده است دراین پژوهش تاثیر دما برپارامترهای ساختمانی پروتئین پریون بوسیله شبیه سازی دینامیک مولکولی با استفاده ازنرم افزار گرومکس درمحیط لینوکس انجام شده است شبیهسازی در مدت زمان 10 نانو ثانیه انجام شده است و بعدازانجام پارامترهای موردنظر ازفایل مسیر حاصل استخراج و تحلیل داده ها انجام میشود براساس نتایج تحقیق مشخص گردید که دومین n-ترمینال پروتئین نسبت به دومین C -ترمینال دردماهای 27و47درجه سانتیگراد متحمل تغییرات ساختاری بیشتری میشود همچنین تغییرات دمایی افزایش یا کاهش دما سبب کاهش شعاع چرخشی دومین N-ترمینال پروتئین میشود

کلیدواژه ها:

پروتئین پریون ، شبیه سازی دینامیک مولکولی ، دما