ارزیابی اتصال اسید گالیک به آلبومین سرم گاوی از طریق داکینگ ملکولی

گیاهان دارویی به واسطه دارا بودن ترکیبات زیست فعال همچون، آلکالوئیدها، فلاونوئیدها و ترکیبات فنولی جایگاه ویژه ای در صنایع دارویی، غذایی و بهداشتی یافته اند. یکی از این ترکیبات مهم اسید گالیک (GA) است که به دلیل ساختار فتلی خود و قابلیت مهار رادیکال های آزاد، از خواص آنتی اکسیدانی و درمانی برجسته ای برخوردار است. مطالعات نشان داده اند که GA در بیماریهایی که استرس اکسیداتیو نقش کلیدی دارد مانند سرطان، بیماریهای قلبی عروقی و فرآیند پیری، اثرات مفیدی از خود نشان میدهد. برای بهبود انتقال و پایداری این ترکیب در بدن، اغلب از پروتئینهایی نظیر آلبومین سرم گاوی بهره گرفته میشود که به دلیل شباهت ساختاری با آلبومین انسانی و توانایی اتصال برگشت پذیر به مولکولهای زیستی گزینه مناسبی به شمار میرود. در این پژوهش، تعامل میان GA و BSA با استفاده از شبیه سازیهای داکینگ مولکولی مورد بررسی قرار گرفت. ساختارهای سه بعدی GA و BSA از پایگاه های داده معتبر استخراج و با نرم افزارهای تخصصی بهینه سازی شدند. نتایج حاصل نشان داد که GA عمدتا طریق پیوندهای هیدروژنی و نیروهای واندروالس به سایت فعال BSA متصل میشود. انرژی داکینگ به دست آمده برابر با ۶.۳- کیلوکالری بر مول بود که بیانگر وجود پیوندی پایدار و غیر کوالانسی میان این دو مولکول است. این یافته ها می تواند در توسعه کاربردهای دارویی ترکیبات پلی فنولی و طراحی سامانههای انتقال هدفمند موثر واقع شود.

کلیدواژه ها:

پروتئین ، لیگاند ، ترکیبات فنلی ، مطالعات شبیه سازی بیوانفورماتیکی