داکینگ مولکولی تعدادی از مشتقات کینازولینون به عنوان مهارکننده EGFR

سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 94

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_YAFTE-23-3_010

تاریخ نمایه سازی: 18 آبان 1404

چکیده مقاله:

مقدمه: موتاسیون هایی که باعث بیان بالای فاکتور رشد اپیدرمی می شوند منجر به ایجاد سرطان می شوند. از این رو، این فاکتور به عنوان یک هدف مولکولی بالقوه برای درمان سرطان است و مهارکننده های این آنزیم در زمینه ی درمان سرطان اهمیت خاصی دارند. هدف این پژوهش بررسی بیوانفورماتیکی مهار آنزیم EGFR بوسیله ی تعدادی از مشتقات کینازولینون است. مواد و روش­ ها: این پژوهش به روش توصیفی – تحلیلی انجام شد. برای بررسی نحوه اتصال مشتقات کینازولینون به جایگاه فعال آنزیم، در ابتدا ساختار شیمیایی ترکیبات با استفاده از نرم افزار ChemBioDrawUltra نسخه ۱۴ ترسیم شد. سپس به منظور بهینه سازی انرژی، به نرم افزار Hyperchem انتقال یافت. مطالعات داکینگ به وسیله نرم افزار AutoDock ۴.۲ انجام شد و در مرحله نهایی، نتایج با استفاده از سه برنامه AutoDockTools ، DS Visualizer و Ligplot مورد آنالیز قرار گرفتند. یافته­ ها: بر اساس نتایج به دست آمده از مطالعات داکینگ، مهم ترین پیوندهای درگیر در اتصال دارو با گیرنده، اتصالات هیدروفوبیک و پیوند هیدروژنی هستند. در میان تمام ترکیبات مورد مطالعه، بهترین نتایج داکینگ مربوط به ترکیب شماره ۳ است. این ترکیب با منفی ترین سطح انرژی اتصال (-۷.۵۳ Kcal/mol ΔGbind=) تمایل بیشتری برای اتصال به اسیدهای آمینه ی کلیدی جایگاه فعال آنزیم EGFR دارد. بحث و نتیجه ­گیری: در پایان با توجه به اثربخشی بالا و نتایج داکینگ می توان نتیجه گرفت که ترکیب شماره ۳ می تواند به عنوان مهار کننده موثر آنزیم EGFR مطرح شود.

نویسندگان

مهدی رفیعیان بروجنی

Faculty of Pharmacy, Lorestan University of Medical Sciences, Khorramabad, Iran

رضوان رضایی نسب

Department of Medicinal Chemistry, Faculty of Pharmacy, Lorestan, University of Medical Sciences, Khorramabad, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Khan I, Nisar M, Ahmad M, Shah H, Iqbal Z, ...
  • Ohadi B, Azarnoosh E, Vazirian M, Yasrebinezhad Z. Using polysaccharides ...
  • Motaleb Gh, Mazaher M, Mir Z, Najafi Sh. Evaluation of ...
  • Kim Y, Ko J, Cui Z, Abolhoda A, Ahn JS, ...
  • Albanell J, Rojo F, Averbuch S, Feyereislova A, Mascaro JM, ...
  • Kalyankrishna S, Grandis JR. Epidermal growth factor receptor biology in ...
  • Amann J, Kalyankrishna S, Massion PP, Ohm JE, Girard L, ...
  • Schiff BA, McMurphy AB, Jasser SA, Younes MN, Doan D, ...
  • Riely GJ, Pao W, Pham D, Li AR, Rizvi N, ...
  • Kim Y, Ko J, Cui Z, Abolhoda A, Ahn JS, ...
  • Jayashree BS, Thomas S, Nayak Y. Design and synthesis of ...
  • Kitchen DB, Decornez H, Furr JR, Bajorath J. Docking and ...
  • Huang S-Y, Zou X. Advances and challenges in protein-ligand docking. ...
  • Ciardiello F. and Tortora G. EGFR antagonists in cancer treatment. ...
  • Huang, S-Y and Zou X. Advances and challenges in protein-ligand ...
  • Khodair, AI, Alsafi MA, and Nafie MS, Synthesis, molecular modeling ...
  • Morris GM, Huey R, Lindstrom W, Sanner MF, Belew RK, ...
  • Berman HM, Battistuz T, Bhat TN, Bluhm WF, Bourne PE, ...
  • Stamos J, Sliwkowski MX, Eigenbrot C. Structure of the epidermal ...
  • Coleman WF, Arumainayagam CR. HyperChem ۵ (by Hypercube, Inc.). J ...
  • Huang SY, Zou X. Advances and challenges in protein-ligand docking. ...
  • Mukesh B, Rakesh K. Molecular docking: a review. J Res ...
  • Ismail RS, Ismail NS, Abuserii S, El Ella DAA. Recent ...
  • Al-Suwaidan IA, Abdel-Aziz AA, Shawer TZ, Ayyad RR, Alanazi AM, ...
  • Babu YR, Bhagavanraju M, Reddy GD, Peters GJ, Prasad VV. ...
  • Ahmed MF, Belal A, Youns M. Design, synthesis, molecular modeling ...
  • نمایش کامل مراجع