روشهای ارزیابی کیفیت مبتنی بر هوش مصنوعی برای مدلهای ساختار پروتئین

زیست شناسی ساختاری شاهد افزایش قابل توجهی در استفاده از میکروسکوپ الکترونی برودتی (cryo-EM) برای تعیین ساختارهای پروتئینی سه بعدی بوده است. وضوح بازسازیهای cryo-EM به طور چشمگیری بهبود یافته است. حتی با پیشرفتهای اخیر در دستیابی به وضوح بالا، تفسیر نقشه های cryo-EM برای ساخت ساختارهای پروتئینی دقیق یک چالش مهم باقی مانده است. جامعه cryo-EM اهمیت اعتبارسنجی نقشه های cryo-EM و مدلهای ساختاری را از روی نقشه ها برای سال ها تشخیص داده است. با توجه به این چالش ها، جامعه توصیه های خاص مختلفی را برای اعتبارسنجی نقشه و مدل ارائه کرده است که منجر به توسعه روش های محاسباتی متعددی برای ارزیابی کیفیت نقشه ها و مدلهای ساختاری می شود. در این مقاله، انواع مختلف روش های اعتبارسنجی مورد بحث قرار می گیرد و نمونه هایی از روش های ارزیابی مبتنی بر هوش مصنوعی برای نشان دادن کاربردهای عملی آنها ارائه می شود.

کلیدواژه ها:

میکروسکوپ الکترونی کریو ، مدل سازی ساختاری ، کریو-EM ، زیست شناسی ساختار ، ارزیابی کیفیت مدل ، اعتبارسنجی ، مدل یادگیری عمیق