Phylogenetic study of Adonis in Iran using nuclear and plastid DNA data

سال انتشار: 1404
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 120

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ROST-26-1_004

تاریخ نمایه سازی: 20 مهر 1404

چکیده مقاله:

The genus Adonis is predominantly distributed in the temperate regions of the Northern Hemisphere. The present study is aimed to elucidate the phylogenetic relationship within the Iranian species of the genus Adonis. A molecular phylogenetic approach, based on nrDNA ITS and cpDNA trnL-F sequences, was applied to six species, one subspecies, and three varieties. Phylogenetic analyses were conducted using parsimony and Bayesian inference methods implemented in MEGA and PAUP softwares. The results confirmed the monophyly of Adonis sect. Adonis, consistent with previous studies. In the phylogenetic tree inferred from nrDNA ITS data, species of Trollius clustered together with the perennial species of Adonis (sect. Consiligo) in a single clade, whereas seven taxa of Adonis (sect. Adonis) formed a separate clade. In contrast, the cpDNA trnL-F data revealed that, all the species of Adonis (sect. Adonis and sect. Consiligo) grouped together in a single clade, while the perennial species of Trollius formed a distinct clade. In this analysis, the two clades were separated with ۹۷% bootstrap support. Furthermore, the taxonomic position of A. globosa as a subspecies of A. microcarpa and A. microcarpa as a distinct species was confirmed.

نویسندگان

منیژه پاکروان

Associate Prof., Department of Plant Sciences, Faculty of Biological Science, Alzahra University, Tehran, Iran

علی سنبلی

Prof., Department of Biology Medicinal Plants & Drugs Research Institute, Shahid Beheshti University, Tehran, Iran

الهام شجاعی نیا

PhD Student of Pharmacology, Department of Pharmacy, University of Oslo, Norway

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Davis, P.H. ۱۹۶۵. Flora of Turkey and the East Ageon ...
  • De Candolle, A.P. (ed.). ۱۸۱۸. Adonis. Pp. ۲۲۰–۲۲۶. In: Regni ...
  • Felsenstein J. ۱۹۸۵. Confidence limits on phylogenies: An approach using ...
  • Escobar Garcia, P., Pakravan, M., Schönswetter, P., Fuertes Aguilar, J. ...
  • Fereidounfar, S., Ghahremaninejad, F. & Khajehpiri, M. ۲۰۱۶. Phylogeny of ...
  • Ghafari, S.M. ۱۹۸۷. Chromosome counts of some angiosperms from Iran ...
  • Ghorbani-Nohooji, M., Azizian, D., Sheidai, M. & Khatamsaz, M. ۲۰۰۸. ...
  • Ghorbani-Nohooji, M., Azizian, D., Sheidai, M. & Khatamsaz, M. ۲۰۱۲. ...
  • Gostin, I.N. ۲۰۰۹. Scanning electron microscopy investigation regarding Adonis vernalis ...
  • Hall, T.A. ۱۹۹۹. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor ...
  • Heywood, V.H., Brummitt, R.K., Culham, A. & Seberg, O. ۲۰۰۷. ...
  • Hoot, S.B. ۱۹۹۵. Phylogeny of Ranunculaceae, based on preliminary atpB, ...
  • Huelsenbeck, J.P. & Ronquist, F. ۲۰۰۱. MrBayes: Bayesian inference of ...
  • Hutchinson, J. ۱۹۲۳. Contribution towards a phylogenetic classification of flowering ...
  • Imam, M., Chrtek, J. & Slavikova, Z. ۱۹۷۷. Die Gattung ...
  • Iranshahr, M., Rechinger, K.H. & Riedle, H. ۱۹۹۲. Ranunculaceae. Pp. ...
  • Janchen, E. ۱۹۴۹. Die systematische Gliederung der Ranunculaceae und Berberidaceae. ...
  • Jensen, U., Hoot, S.B., Johansson, J.T. & Kosuge, K. ۱۹۹۵. ...
  • Najariyan, F., Sheidai, M., Koohdar, F. & Talebi, S.M. ۲۰۲۰. ...
  • Pakravan, M. & Sharifnia, F. ۲۰۲۳. Ranunculaceae. Pp. ۱۳۴–۱۴۷. In: ...
  • Nei, M. & Kumar, S. ۲۰۰۰. Molecular Evolution and Phylogenetics. ...
  • Pushkurlat, A.P. ۲۰۰۰. The genus Adonis L. - Pheasant's eye. ...
  • Reynaud, C., Verlaque, R. & Filosa, D. ۱۹۹۳. Mediterranean chromosome ...
  • Riedle, V.H. ۱۹۶۳. Revisione der einjahrigen Arten von Adonis L. ...
  • Ro, L., Keener, C.S. & Mc Pheron, B.A. ۱۹۹۷. Molecular ...
  • Ronquist, F. & Huelsenbeck, J.P. ۲۰۰۳. MrBayes ۳: Bayesian phylogenetic ...
  • Santisuk, T. ۱۹۷۹. A palynological study of the tribe Ranunculeae. ...
  • Simpson, M.G. ۲۰۰۶. Plant Systematics. Amsterdam: Elsevier ...
  • Swofford, D.L. ۲۰۰۱. PAUP. Phylogenetic Analysis Using Parsimony (and Other ...
  • Soltis, D.E., Soltis, P.S., Endress, P.K. & Chase, M.W. ۲۰۰۵. ...
  • Son, D.C., Park, B.K. & Ko, S.C. ۲۰۱۶. Phylogenetic study ...
  • Steinberg, ۱۹۷۱. Revisione sistematica a distributiva delle Adonis annuli in ...
  • Taberlet, P., Gielly, L., Pautou, G. & Bouvet, J. ۱۹۹۱. ...
  • Tamura, M. ۱۹۹۳. Ranunculaceae. Pp. ۵۶۳–۵۸۳. In: Kubitzki, K., Rohwer, ...
  • Tamura, M. ۱۹۹۵. Angiospermae. Ordnung Ranunculales. Fam. Ranunculaceae. II. Systematic ...
  • Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei, M. ...
  • Wu, Z.Y., Lu, A.M. & Tang, Y.C. ۲۰۰۳. The Families ...
  • Wang, W., Lu, A.M., Ren, Y., Endress, M.E. & Chen, ...
  • White, T.J., Bruns, T., Lee, S. & Taylor, J. ۱۹۹۰. ...
  • نمایش کامل مراجع