بخش بندی سلول های مربوط به جنین زنده در تصاویر کانفوکال سه بعدی

در این مقاله از بخشبندی مبتنی بر معادلات دیفرانسیل جزئی استفاده نموده ایم تا با دقتی بالا، شکلهای غشاء و هسته ها را از تصاویر میکروسکوپ گذر زمانی کانفوکال (با فاصله کانونی برابر) استخراج نماییم. این تصاویر از جنین اولیهء Zebrafish گرفته شده است. این استراتژی پیشنیازی برای آنالیز دقیق کمی شکل سلول ها و مورفودینامیک آن ها (دینامیک شکلی) در طول شکل گیری اندامها است و مبنایی برای درک فرآیندهای بیولوژیکی یکپارچه است. همچنین دادهها برای اندازه گیری تغییرپذیری بین اعضای یک جمعیت به کار میروند. برای بخشبندی ساختارهای سلولی در ابتدا از روش فیلترهای نگهدارندهء لبه های تصویرجهت کاهش نویز استفاده شده است و سپس الگوریتمی بر اساس تکنیک سطوح درونی جهت بازسازی شکل سلول به کار برده شده است.

کلیدواژه ها:

معادلات دیفرانسیل جزیی ، قطعه بندی ، تصاویر ، کانفوکال ، مورفودینامیک