بررسی ویروس پیچیدگی برگ زرد گوجه فرنگی در استان بوشهر

گوجه فرنگی یکی از سبزیجات مهم و بیماری پیچیدگی برگ زرد گوجه فرنگی از مهمترین بیماریهای گوجه فرنگی در سراسر دنیاست. طی فصل های زمستان ۱۳۹۱ و بهار ۱۳۹۲، به منظور بررسی ویروس پیچیدگی برگ زرد گوجه فرنگی در استان بوشهر از مزارع کشت گوجه فرنگی واقع در شهرستانهای تنگ ارم، دشتستان و چند بخش مربوط به آن از گیاهان مشکوک به آلودگی نمونه برداری شد. پس از استخراج DNA، واکنش زنجیره ای پلیمراز با استفاده از آغازگرهای sense و antisense منجر به تکثیر قطعه ای با اندازه تقریبی۵۵۰ جفت باز از ژن پروتئین پوششی و حرکتی ویروس شد. محصول واکنش زنجیره ای پلی مراز متعلق به سه جدایه، برای تعیین ترادف انتخاب و به کره ارسال شدند. ژن های توالی یابی شده در بانک ژن جهانی ثبت گردیدند. تجزیه داده ها نیز به دنبال همردیف سازی آنها با بانک ژن جهانی با استفاده از نرم افزار clustalw انجام و درخت فیلوژنتیکی حاصل با نرم افزار mega۶ با ۱۰۰۰ bootstrap ترسیم گردید. آنالیز های فیلوژنتیکی نشان داد که جدایه های مورد بررسی در دو گروه جداگانه A و B قرار گرفتند. در این تقسیم بندی در گروه A جدایه های دشتستان (KP۶۳۵۴۴۷) و تنگ ارم (KP۶۳۵۴۴۸) به جدایه های مورد بررسی در کشورهای دیگر از جمله چین (AY۵۹۴۱۹۴) و ونزوئلا (EF۶۲۵۸۹۵) و به جدایه های مورد بررسی در داخل کشور از جمله شیراز (GU۰۷۶۴۴۴) و تهران (KC۱۰۶۶۴۸، KC۵۸۲۱۵۰) نزدیک بودند. در گروه B جدایه ای دیگر از دشتستان (KP۶۳۵۴۴۶) به جدایه های کشورهای عربی از جمله عربستان (HM۵۹۰۵۵۸)، عمان (KF۲۲۹۷۲۱، KF۲۲۹۷۲۵) و به جدایه داخلی جیرفت (GU۰۷۶۴۵۰) نزدیک می باشد. نتایج حاصل نشان می دهد که ویروس پیچیدگی برگ زرد گوجه فرنگی در ایران و همچنین در یک منطقه (دشتستان) دارای تنوع ژنتیکی بوده و برای تعیین وجود نژادهای نوترکیب جدید نیاز به تحقیقات بیشتری بر روی جدایه های ایرانی می باشد. همچنین علائم متفاوتی با توجه به نوع رقم میزبان، منطقه جمع آوری نمونه و همچنین آلوده شدن گیاه در زمان های متفاوت ایجاد می کنند.