توالی یابی و رسم درخت فیلوژنیک باکتری های اندوفیت گیاه Rhabdosciadium Aucheri به روش Sanger Sequencing و تعیین اثر ضد قارچی آنها
محل انتشار: فصلنامه دانش و تندرستی، دوره: 20، شماره: 2
سال انتشار: 783
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 26
فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JKH-20-2_003
تاریخ نمایه سازی: 30 شهریور 1404
چکیده مقاله:
مقدمه: خواص منحصر به فرد باکتری های اندوفیت به خوبی مشخص نیست. باکتری های اندوفیت برخی گیاهان مانند Rhabdosciadium aucheri، ممکن است با خواص ضدمیکروبی قارچ های بیماری زا از بین ببرند. هدف از این مطالعه توالی یابی و رسم درخت فیلوژنیک باکتری های اندوفیت گیاه R.aucheri به روش sanger sequencing و تعیین اثر ضد قارچی آنها می باشد.مواد و روش ها: نمونه های گیاهی در این مطالعه توصیفی- تحلیلی با روش تصادفی و آسان و در دسترس جمع آوری شدند. روش کشت بر روی پلیت برای شناسایی اولیه باکتری های اندوفیت استفاده گردید. روش PCR برای تشخیص مولکولی باکتری های اندوفیت و تعیین توالی بهینه سازی شد. اثر مهاری این باکتری های اندوفیت بر آسپرژیلوس نایجر و کاندیدا آلبیکنز به روش کشت متقاطع سنجیده شد.نتایج: از مجموع ۱۰۰ ایزوله ی باکتریایی جدا شده از R.aucheri، ۹ ایزوله (۹%) باسیلوس پومیلوس، ۱۵ ایزوله (۱۵%) باسیلوس سوبتیلیس، ۱۲ ایزوله (۱۲%) سراشیا فیکاریا، ۱۴ ایزوله (۱۴%) باسیلوس آمیلولیکوفاسینس، ۸ ایزوله (۸%) پانتوئه آ آگلومرانس و ۷ ایزوله (۷ درصد) سوداروباکتر اکسیدانس بودند. نتایج تعیین توالی نشان دادند که تفاوت گونه های مختلف باسیلوس مربوط به جایگاه های T و G بودند. همچنین باسیلوس های جداسازی شده بیشترین تاثیر را برروی قارچ آسپرژیلوس نایجر نشان دادند.نتیجه گیری: با استناد به نتایج ما، ریشه گیاه R.aucheri محلی مناسب برای جداسازی باسیلوس های دارای پتانسیل بالای ضد میکروبی است. همچنین مشخص شد که گونه باسیلوس سوبتیلیس در مقایسه با باکتری های دیگر قدرت بیشتری برای مهار قارچ های بیماری زا دارد.مقدمه: خواص منحصر به فرد باکتری های اندوفیت به خوبی مشخص نیست. باکتری های اندوفیت برخی گیاهان مانند Rhabdosciadium aucheri، ممکن است با خواص ضدمیکروبی قارچ های بیماری زا از بین ببرند. هدف از این مطالعه توالی یابی و رسم درخت فیلوژنیک باکتری های اندوفیت گیاه R.aucheri به روش sanger sequencing و تعیین اثر ضد قارچی آنها می باشد. مواد و روش ها: نمونه های گیاهی در این مطالعه توصیفی- تحلیلی با روش تصادفی و آسان و در دسترس جمع آوری شدند. روش کشت بر روی پلیت برای شناسایی اولیه باکتری های اندوفیت استفاده گردید. روش PCR برای تشخیص مولکولی باکتری های اندوفیت و تعیین توالی بهینه سازی شد. اثر مهاری این باکتری های اندوفیت بر آسپرژیلوس نایجر و کاندیدا آلبیکنز به روش کشت متقاطع سنجیده شد. نتایج: از مجموع ۱۰۰ ایزوله ی باکتریایی جدا شده از R.aucheri، ۹ ایزوله (۹%) باسیلوس پومیلوس، ۱۵ ایزوله (۱۵%) باسیلوس سوبتیلیس، ۱۲ ایزوله (۱۲%) سراشیا فیکاریا، ۱۴ ایزوله (۱۴%) باسیلوس آمیلولیکوفاسینس، ۸ ایزوله (۸%) پانتوئه آ آگلومرانس و ۷ ایزوله (۷ درصد) سوداروباکتر اکسیدانس بودند. نتایج تعیین توالی نشان دادند که تفاوت گونه های مختلف باسیلوس مربوط به جایگاه های T و G بودند. همچنین باسیلوس های جداسازی شده بیشترین تاثیر را برروی قارچ آسپرژیلوس نایجر نشان دادند. نتیجه گیری: با استناد به نتایج ما، ریشه گیاه R.aucheri محلی مناسب برای جداسازی باسیلوس های دارای پتانسیل بالای ضد میکروبی است. همچنین مشخص شد که گونه باسیلوس سوبتیلیس در مقایسه با باکتری های دیگر قدرت بیشتری برای مهار قارچ های بیماری زا دارد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
نگیسا زارعی
- کارشناس ارشد میکروبیولوژی، گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد همدان، همدان، ایران.
رضا حبیبی پور
- دانشیار، گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی واحد همدان، همدان، ایران.
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
