بررسی مولکولی برخی ژن ها در ایزوله های کلبسیلا پنومونیه از موارد بالینی مختلف

هدف: این مطالعه با هدف بررسی شیوع کلبسیلا پنومونیه به عنوان عامل اصلی ذات الریه در استان المثنی، عراق، و بررسی پروفایل مولکولی ژن های بیماری زایی مرتبط با هایپرموکوویسکوزیته (مانند magA و rmpA) در سویه های اپیدمیک جدا شده از نمونه های دستگاه تنفسی تحتانی بیماران بستری مبتلا به ذات الریه در بیمارستان الرمیثه انجام شد. علاوه بر این، شیوع سویه های هایپرویرولنت کلبسیلا پنومونیه (hvKp) و سویه های کلاسیک کلبسیلا پنومونیه (cKp) نیز برآورد گردید.مواد و روش ها: در مجموع ۱۰۰ ایزوله باکتریایی از نمونه های دستگاه تنفسی تحتانی بیماران در بیمارستان الرمیثه بین ۱۸ آوریل ۲۰۲۴ و ۱۸ سپتامبر ۲۰۲۴ جمع آوری شد. ایزوله ها از طریق گامه های زیر شناسایی شدند: مورفولوژی کلونی روی آگار مک کانکی، مورفولوژی سلولی از طریق رنگ آمیزی گرم و کپسول و مشاهده زیر میکروسکوپ نوری، آزمایش های فیزیولوژیکی، آزمایش های بیوشیمیایی، شناسایی مولکولی با استفاده از توالی یابی ژن ۱۶S rRNA، و تشخیص ژن های بیماری زایی (magA و rmpA) از طریق واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) با استفاده از پرایمرهای اختصاصی ژن که قطعاتی به طول ۱۲۸۳ جفت باز برای magA و ۴۰۹ و ۳۴۰ جفت باز برای rmpA را تکثیر می کردند.نتایج: از ۱۰۰ ایزوله، ۲۰ مورد پروفایل معمولی کلبسیلا پنومونیه را نشان دادند که هویت آن ها با توالی یابی ژن ۱۶SrRNA تایید شد. توالی های ۱۵ سویه از این ایزوله ها در GenBank تحت شماره های دسترسی PQ۸۱۴۱۶۶ تا PQ۸۱۴۱۸۰ ثبت شدند. تحلیل فیلوژنتیک این ۱۵ سویه را به ۱۰ کلاد تقسیم کرد: کلاد A (PQ۸۱۴۱۶۷, PQ۸۱۴۱۷۷)، کلاد B (PQ۸۱۴۱۷۱)، کلاد C (PQ۸۱۴۱۶۶, PQ۸۱۴۱۷۶)، کلاد D (PQ۸۱۴۱۷۹, PQ۸۱۴۱۸۰)، کلادهای E، F، و G (به ترتیب PQ۸۱۴۱۶۹، PQ۸۱۴۱۷۳، و PQ۸۱۴۱۷۴)، کلاد H (PQ۸۱۴۱۷۰, PQ۸۱۴۱۷۵)، کلاد I (PQ۸۱۴۱۷۲) و کلاد J (PQ۸۱۴۱۶۸, PQ۸۱۴۱۷۸). ژن های هایپرموکوویسکوزیته magA و rmpA به ترتیب در ۵۵% و ۵۰% از ۲۰ ایزوله کلبسیلا پنومونیه شناسایی شدند. شیوع سویه های هایپرویرولنت کلبسیلا پنومونیه (hvKp) ۵۰% بود.نتیجه گیری: این مطالعه تایید می کند که کلبسیلا پنومونیه یک عامل مهم ذات الریه در استان المثنی، با حضور قابل توجه سویه های هایپرویرولنت (۵۰%) که با ژن های magA و rmpA مشخص می شوند است. این یافته ها اهمیت بررسی مولکولی در درک بیماری زایی و اپیدمیولوژی کلبسیلا پنومونیه در محیط های بالینی را برجسته می کند.

کلیدواژه ها:

ژن magA ، ژن rmpA ، کلبسیلا پنومونیه ، ۱۶srRNA