تحلیل ژنومی و تنوع ژننتیکی ژن های مسئول صفات مقاومت به تنش خشکی در گیاهان زراعی بومی ایران با استفاده از تکنیک های تکنیک های نسل جدید توالی یابی ( NGS)

در این پژوهش، به منظور بررسی تنوع ژنتیکی و شناسایی ژن های موثر در مقاومت به تنش خشکی، از تکنیک های نسل جدید توالی یابی (NGS) در پنج گونه زراعی بومی ایران شامل گندم، جو، عدس، ماش و نخود استفاده شد. نمونه ها از مناطق مختلف کشور گردآوری شده و پس از استخراج DNA و آماده سازی کتابخانه ژنومی، توالی یابی بر بستر Illumina NovaSeq انجام گرفت. داده های خام با نرم افزارهای بیوانفورماتیکی پردازش شده و نشانگرهای ژنتیکی مانند SNP و InDel استخراج گردید. تحلیل ساختار جمعیت، تنوع ژنتیکی، و همبستگی ژنوتیپ-فنوتیپ با نرم افزارهای GATK، STRUCTURE، و PLINK صورت گرفت. نتایج نشان دهنده تنوع ژنتیکی بالا در ژرمپالسمهای بومی ایران و شناسایی ژن های کلیدی مانند DREB، LEA، NAC و WRKY در پاسخ به خشکی بود. خوشه بندی ژنوتیپ ها بر اساس اقلیم محل جمع آوری و شاخص های مقاومت (مانند STI و GMP) ارتباط معناداری با برخی واریانتهای خاص نشان داد. این یافته ها می توانند به عنوان مبنایی برای توسعه نشانگرهای مولکولی و اصلاح ژنتیکی گیاهان مقاوم به خشکی مورد استفاده قرار گیرند.

کلیدواژه ها:

تنش خشکی ، تنوع ژنتیکی ، ژرمپالسم بومی ، توالییابی نسل جدید ، ژن های مقاوم