ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

فیلوژنی مولکولی و واگرایی عملکردی یوریدین دی فسفات گلیکوزیل ترانسفرازهای (UGT) موجود در جنس زعفران و همولوگ های آن در سایر گیاهان

محل انتشار: فصلنامه علوم باغبانی ایران، دوره: 55، شماره: 3
سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 189

فایل این مقاله در 18 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/2290445

شناسه ملی سند علمی:

JR_JHS-55-3_006

تاریخ نمایه سازی: 1 تیر 1404

چکیده مقاله:

زعفران زراعی با نام علمی Crocus sativus L. یکی از منابع غنی از آپوکاروتنوئیدها شامل کروسین، پیکروکروسین و سافرانال است. آپوکاروتنوئیدها از شکست اکسیداتیو کاروتنوئیدها حاصل می گردند. گلیکوزیلاسیون مرحله نهایی و بسیار مهم در فرآیند بیوسنتز کروسین است زیرا به رنگدانه خصوصیت حلالیت در آب می بخشد و خواص شیمیایی و زیست فعالی آن مولکول را تغییر می دهد. در این مطالعه، توالی پروتئینی UGTهای موجود در زعفران، همراه با همولوگ های آنها در سایر گیاهان از دیدگاه های مختلف شامل آنالیز فیلوژنی و شناسایی موتیف، آنالیز واگرایی عملکردی و آنالیز ساختاری مورد بررسی قرار گرفت. تمرکز مطالعه روی UGT هایی بود که مسئول گلیکوزیلاسیون اولیه و ثانویه در تولید کروسین در گیاهانی که کروسین در آنها یافت شد، هستند. همچنین، رابطه تکاملی خانواده پروتئین UGT در زعفران و گیاهان دیگر شامل واگرایی عملکردی نوع یک و نوع دو مورد بررسی قرار گرفت. آنالیز فیلوژنی نشان داد که UGT هایی که گلیکوزیلاسیون اولیه را برعهده دارند با UGT هایی که گلیکوزیلاسیون ثانویه را انجام می دهند در دو گروه کاملا جداگانه با بیشترین تفاوت عملکردی قرار گرفتند.. در هر گروه موتیف هایی یافت شد که اختصاصی همان گروه بودند و در این موتیف های اختصاصی، اسید آمینه هایی با ضریب واگرایی عملکردی بالا شناسایی شد که می توان این واحدها را به تفاوت عملکردی این توالی ها نسبت داد. این یافته ها ممکن است تحقیقات آینده را با هدف مشخص کردن عملکرد این ژن ها تسهیل کند.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

مریم فلاح

گروه علوم باغبانی و مهندسی فضای سبز، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تهران، کرج، ایران

روح انگیز نادری

گروه علوم باغبانی و مهندسی فضای سبز، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تهران، کرج، ایران

سید علیرضا سلامی

گروه علوم باغبانی و مهندسی فضای سبز، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تهران، کرج، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abhiman, S., Daub, C. O., & Sonnhammer, E. L. L. ...
  • Ahmed, A., Peters, N. R., Fitzgerald, M. K., Watson, J. ...
  • Ahrazem, O., Diretto, G., Argandoña, J., Rubio-Moraga, Á., Julve, J. ...
  • Ahrazem, O., Rubio-Moraga, A., Mozos, A. T., & Gómez-Gómez, M. ...
  • Ahrazem, O., Rubio-Moraga, A., Trapero-Mozos, A., Climent, M. F. L., ...
  • Arnau, V., Gallach, M., Lucas, J. I., & Marín, I. ...
  • Bharatham, K., Zhang, Z. H., & Mihalek, I. (۲۰۱۱). Determinants, ...
  • Breton, C., Fournel-Gigleux, S., & Palcic, M. M. (۲۰۱۲). Recent ...
  • Breton, C., & Imberty, A. (۱۹۹۹). Structure/function studies of glycosyltransferases. ...
  • Caballero-Ortega, H., Pereda-Miranda, R., & Abdullaev, F. I. (۲۰۰۷). HPLC ...
  • Chagoyen, M., García-Martín, J. A., & Pazos, F. (۲۰۱۶). Practical ...
  • Christodoulou, E., Kadoglou, N. P. E., Kostomitsopoulos, N., & Valsami, ...
  • del Sol Mesa, A., Pazos, F., & Valencia, A. (۲۰۰۳). ...
  • Demurtas, O. C., Frusciante, S., Ferrante, P., Diretto, G., Azad, ...
  • Diretto, G., Ahrazem, O., Rubio‐Moraga, Á., Fiore, A., Sevi, F., ...
  • Gu, X. (۲۰۰۳). Functional divergence in protein (family) sequence evolution. ...
  • Gu, X., Zou, Y., Su, Z., Huang, W., Zhou, Z., ...
  • Holm, L., Laiho, A., Törönen, P., & Salgado, M. (۲۰۲۳). ...
  • Illergård, K., Ardell, D. H., & Elofsson, A. (۲۰۰۹). Structure ...
  • Lai, C., Yang, N., Yusuyin, M., Zhang, D., Yang, Y., ...
  • Le Roy, J., Huss, B., Creach, A., Hawkins, S., & ...
  • Li, L., Shakhnovich, E. I., & Mirny, L. A. (۲۰۰۳). ...
  • Liang, Z., Yang, M., Xu, X., Xie, Z., Huang, J., ...
  • Lim, E., & Bowles, D. J. (۲۰۰۴). A class of ...
  • López-Jimenez, A. J., Frusciante, S., Niza, E., Ahrazem, O., Rubio-Moraga, ...
  • Mandai, T., Yoneyama, M., Sakai, S., Muto, N., & Yamamoto, ...
  • Meng, L., Liu, X., He, C., Xu, B., Li, Y., ...
  • Mirny, L. A., & Gelfand, M. S. (۲۰۰۲). Using orthologous ...
  • Modolo, L. V, Blount, J. W., Achnine, L., Naoumkina, M. ...
  • Moraga, Á. R., Mozos, A. T., Ahrazem, O., & Gómez-Gómez, ...
  • Nagatoshi, M., Terasaka, K., Owaki, M., Sota, M., Inukai, T., ...
  • Naylor, G. J. P., & Gerstein, M. (۲۰۰۰). Measuring shifts ...
  • Nguyen Ba, A. N., Strome, B., Hua, J. J., Desmond, ...
  • Offen, W., Martinez‐Fleites, C., Yang, M., Kiat‐Lim, E., Davis, B. ...
  • Ohno, S. (۲۰۱۳). Evolution by gene duplication. Springer Science & ...
  • Pennisi, E. (۲۰۲۱). Protein structure prediction now easier, faster. American ...
  • Pfister, S., Meyer, P., Steck, A., & Pfander, H. (۱۹۹۶). ...
  • Pu, X., He, C., Yang, Y., Wang, W., Hu, K., ...
  • Rahimi, S., Kim, J., Mijakovic, I., Jung, K.-H., Choi, G., ...
  • Swint-Kruse, L. (۲۰۱۶). Using evolution to guide protein engineering: the ...
  • Trapero, A., Ahrazem, O., Rubio-Moraga, A., Jimeno, M. L., Gómez, ...
  • Tunyasuvunakool, K., Adler, J., Wu, Z., Green, T., Zielinski, M., ...
  • Umesono, K., & Evans, R. M. (۱۹۸۹). Determinants of target ...
  • Verma, V. V., Gupta, R., & Goel, M. (۲۰۱۵). Phylogenetic ...
  • Vogt, T., & Jones, P. (۲۰۰۰). Glycosyltransferases in plant natural ...
  • Wang, M., Ji, Q., Lai, B., Liu, Y., & Mei, ...
  • Wang, X. (۲۰۰۹). Structure, mechanism and engineering of plant natural ...
  • Weymouth-Wilson, A. C. (۱۹۹۷). The role of carbohydrates in biologically ...
  • Winterhalter, P., & Rouseff, R. L. (۲۰۰۱). Carotenoid-derived aroma compounds. ...
  • Xi, L., & Qian, Z. (۲۰۰۶). Pharmacological properties of crocetin ...
    • نمایش کامل مراجع