آنالیز مولکولی ویروس هپاتیت دلتا

ویروس هپاتیت دلتا، ویروس RNA دار ناقصی است که برای عملکرد آن حضور ویروس هپاتیت B ضروری است. این ویروس می تواند منجر به بیماری کبدی حاد و مزمن شود. سویه های HDV به ۷ ژنوتیپ و ۸ شاخه طبقه بندی شده اند. میزان شیوع عفونت HDV در اهداکنندگان خون ایران از ۴/۲ تا ۱۰ درصد متفاوت است. هدف از این مطالعه مقایسه فیلوژنتیک ویروس هپاتیت دلتای جدا شده از بیماران HBsAg مثبت شهرستان شهرکرد با سایر نقاط دنیا می باشد. در این مطالعه ۳۵۰ نمونه سرمی از افراد مبتلا به هپاتیت B، از سازمان انتقال خون شهرستان شهرکرد تهیه شد. در این تحقیق RNA ویروس هپاتیت دلتا با استفاده از کیتRNX Plus ساخت شرکت سیناژن، ایران استخراج گردید. پس از ساخت cDNA با استفاده از کیت RT PreMix ساخت شرکت بایونر[۱]، آلمان نمونه های مثبت با استفاده از کیت تخلیص PCR ساخت شرکت راچ[۲] آلمان تخلیص شدند و جهت تعیین توالی قطعه ۴۲۱ جفت بازی به شرکت ماکروژن[۳] کره ارسال گردیدند. سپس ۲ نمونه مثبت مورد نظر با استفاده از نرم افزارکلستال ایکس[۴] با توالی های ثبت شده این ژن در بانک ژنی NCBI مقایسه و بعد از تعیین میزان مشابهت، درخت فیلوژنی حاصله به کمک نرم افزار ان جی پلات[۵] ترسیم گردید. توالی HDVAg ایزوله های ایرانی در این مطالعه با ۱۵ توالی از ایزوله های HDV از کشورهای مختلف مقایسه شد. نمونه های مورد مطالعه دارای ۷/۹۹-۱/۹۹ درصد قرابت با توالی های این ویروس از کشور های جنوب شرقی آسیا ( چین و تایوان ) بودند. بر پایه مطالعات قبلی می توان این ویروس ها را در شاخه ی ژنوتیپ II ویروس HDV قرار داد.

کلیدواژه ها:

ژنوتیپ II ویروس ، قرابت فیلوژنتیک ، ویروس هپاتیت دلتا