بررسی فراوانی جهش در بیماران SARS-CoV-۲ مثبت

شیوع بیماری کروناویروس ۲۰۱۹، ناشی از سندرم حاد تنفسی جدید کروناویروس (SARS-CoV-۲)، به یک بحران بهداشت جهانی در حال تکامل تبدیل شده است. ژن اسپایک(S)، مسئول تولید پروتئین اسپایک است که به ویروس کمک می کند تا به سلول های انسانی متصل شود و وارد آن ها شود. جهش های این ژن می توانند تاثیرات قابل توجهی بر روی قابلیت انتقال ویروس، شدت بیماری و همچنین اثربخشی واکسن ها داشته باشند.هدف از تحقیق حاضر بررسی میزان فراوانی جهش در بیماران بستری آلوده به SARS-CoV-۲ بوده است. تحقیق حاضر نوعی تحقیق توصیفی- مقطعی است و بر روی ۷۰ بیمار مبتلا به کووید-۱۹ بستری در بیمارستان افضلی پور شهر کرمان، انجام شد . استخراج RNA از نمونه تنفسی افراد مورد مطالعه و سپس سنتز cDNA با استفاده از کیت انجام شد. شناسایی ویروس ، به روش ریل تایم پی سی ار سایبرگرین انجام پذیرفت.همچنین نمونه های کوید مثبت، به روش سنگر تعیین توالی شدند و فراوانی جهش در آن ها بررسی شد. کلیه نمونه های مثبت مورد بررسی SARS-CoV-۲ ، شامل جایگزینی در موقعیت ۲۴۵۲۵ از ژن S بودند و نوکلئوتید C با T جایگزین شده بود که منجر به جایگزینی اسید آمینه هیستیدین به تیروزین شده است. تحلیل توالی پروتئین با استفاده از نرم افزار آنلاین نشان داد که این جهش ها باعث تغییر در سطح اسیدآمینه شده و قادر به تغییر ساختار سه بعدی پروتئین اسپایک در SARS-CoV-۲ نبودند.هر چند جهش های با عدم توانایی تغییر در ساختار سه بعدی پروتئین ها به گیرنده های مرتبط با سیستم ایمنی به واکنش نشان نمی دهند و با وجود این بررسی جهش های می تواند به توسعه داروهای جدید برای مهار ویروس و کاهش عوارض بیماری کووید-۱۹ کمک کند.

کلیدواژه ها:

کووید ۱۹ ، ژن اسپایک ، موتاسیون