مطالعات فیلوژنی پروتئین Dehydrin در گیاهان خانواده Poaceae از طریق آنالیز In silico

افزایش تحمل به سرما و بی آبی در گ یاهان تحت تنش موجب افزایش بقاء آنها در طبیعت بوده است. خانواده بزرگ پروتئینهای Dehydrin در پاسخ به کاهش آب در گیاه ساخته می شوند. پروتئین Dehydrin 1 متعلق به این خانواده بوده و به طور مؤثر در هنگام تنش سرما و بی آبی در گیاه تولید می شود. اعضای این خانواده در این ارتباط بوسیله نامشان متفاوتند. بیوانفورماتیک ابزار ساسیت که نه تنها در زمینه مطالعات پایه ای که در زمینه های علوم بیوتکنولوژی و بیودارویی بخصوص در سالهای اخیر بسیار مورد استفاده است. در این تحقیق برای مطالعه روابط فیلوژنی جنسهای مختلف خانواده Poaceae با استفاده از آنالیز In silico توالیهای Fasta کامل اسیدآمینه 9 پروتئین Dehydrin 1 از 9 جنس خانواده Poaceae از طریق سایت NCBI استخراج گردید و با استفاده از نرم افزار آنلاین EMBle-Ebi ماتریس تفاوتها بین 9 جنس انتخاب شده بر پایه پروتئین Dehydrin 1 بدست آمد و همچنین به وسیله نرم افزار MEGA 4 درخت فیلوژنی رسم گردید. براساس نتایج این گیاهان به دو گروه عمده تقسیم شدند گروه دوم شامل Hordium vulgar و Secale cereal می باشد. نمونه های گروه اول نیز در دو زیرگروه که زیرگروه اول شامل Paspalum juergensii, Aegilops umbellulata, Zea mays و Sorghum bicolor و در زیرگروه دوم شامل Hordium vulgar Sub sp. vulgar, Hordium vulgar Sub sp. Spontaneum و Oryza sativa می باشد، قرار گرفتند.

کلیدواژه ها:

، Poaceae ، بیوانفورماتیک ، Dehydrin 1 ، فیلوژنی