تعیین ژنوتیپ چندشکلی ژنتیکی VNTR در ناحیه پروموتر ژن (XRCC5 (Ku80 با استفاده از روش آنالیز منحنی ذوب با تفکیک بالا (HRMA)

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,041

فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS12_1014

تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392

چکیده مقاله:

ژن (XRCC5 (Ku80 به عنوان عضوی از مسیر Non-homologous end joining نقش مهمی در ترمیم آسیب های دورشته ای DNA برعهده دارد. چند شکلی ژنتیکی VNTR (rs61471712) در ناحیه پروموتر این ژن، قادر است بیان این ژن را تحت تأثیر قرار دهد. در مطالعات گذشته به منظور تعیین ژنوتیپ این چندشکلی از روش PCR سنتی و الکتروفورز ژل آگاروز استفاده شده است. روش آنالیز منحنی ذوب با تفکیک بالا (HRMA)، روشی نوین جهت تعیین ژنوتیپ تنوعات ژنتیکی می باشد. علی رغم قابلیت های بالای این روش، توانایی آن در شناسایی توالی های تکراری کوتاه پشت سرهم هنوز مشخص نیست. در مطالعه حاضر، DNA استخراج شده از خون محیطی 138 فرد داوطلب با روش های HRMA و ا لکتروفورز ژل آگاروز برای ناحیه پروموتر ژن XRCC5 تعیین ژنوتیپ گردید و نتایج کاملاً مشابهی به دست آمد. با توجه به نتایج این بررسی می توان نتیجه گرفت که روش HRMA می تواند به منظور تعیین ژنوتیپ دقیق و کامل توالی های تکراری کوتاه پشت سرهم مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه ها:

ژن (XRCC5 (Ku80 ، چندشکلی VNTR ، تعیین ژنوتیپ ، آنالیز منحنی ذوب با تفکیک بالا (HRMA)

نویسندگان

مهرداد رجایی

دانشجوی کارشناسی ارشد رشته زیست شناسی سلولی و مولکولی، دانشگاه شیراز، ایران

ایرج سعادت

استادیار بخش زیست شناسی، دانشگاه شیراز، ایران

مصطفی سعادت

استاد بخش زیست شناسی، دانشگاه شیراز، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Cai, Q.Q., Plet, A., Imbert, J., Lafage -Pochitaloff, M., Cerdan, ...
  • Ludwig, D.L, Chen, F., Peterson, S.R., Nussenzweig, A., Li, G.C., ...
  • Wang, S., Wang, M., Yin, S., Fu, G., Li, C., ...
  • Wang, G., Wang, S., Shen, Q., Yin, S., Li, C., ...
  • Santos, P.C., Soares, R.A., Krieger, J.E., Guerra-S hinohara, E.M., Pereira, ...
  • Vaughn, C.P., E le nito ba-Johnson, K.S. (2004). High-res olution ...
  • Reed, G.H., Kent, J.O., Wittwer, C.T. (2007). High-res olution DNA ...
  • Wittwer, C.T. (2009). High-res olution DNA melting analysis: advancements and ...
  • Price, E.P., Smith, H., Huygens, F., Giffard, P.M. (2007). High-res ...
  • Pornprasert, S., Phusua, A., Suanta, S., Saetung, R., S anguans ...
  • نمایش کامل مراجع