الگوی هموزیگوسیتی، هتروزیگوسیتی و همخونی ژنومی در جمعیت گوسفندان حساس و مقاوم به گندیدگی سم

در مطالعه حاضر، ضریب همخونی ژنومی بر اساس الگوی هموزیگوسیتی در مناطق ژنومی گوسفندان حساس و مقاوم به گندیدگی سم برآورد شد.  برای این منظور،  از گوسفندان آلپاین سوئیس ) ۱۵۴ راس حیوان سالم در مقابل ۷۶ راس حیوان بیمار شدید) که با تراشه  SNP ۶۰۰K تعیین ژنوتیپ شده بودند، استفاده شد. ضریب همخونی ژنومی از ۰۳/۰ تا ۱۳/۰، با میانگین ۰۹/۰ برای کل ژنوم متغیر بود. بیشترین درصد ضریب همخونی ژنومی مربوط به کروموزوم ۲ (۵/۸۵ درصد در ۶۵ شمارش) و ۱ (۳/۸۴ درصد در ۱۲۹ شمارش) و کمترین درصد آن مربوط به کروموزوم ۸ (۶۵/۰ درصد در ۱ شمارش) بود. در جمعیت سالم ۶۸۹۵۹ الگوی هموزیگوسیتی و ۷۳۱۰۲۶ الگوی هتروزیگوسیتی و در جمعیت بیمار ۳۴۵۶۹  الگوی هموزیگوسیتی و ۳۶۴۱۲۵  الگوی هتروزیگوسیتی شناسایی شد. با استفاده از الگوی هموزیگوسیتی، بالاترین درصد مشاهدات جمعیت سالم (۷۹/۹۸ درصد) مربوط به دسته ۰-۶  مگا جفت­باز و کمترین درصد مشاهدات (۰۱/۰ درصد) مربوط به دسته بیش از ۴۸ مگا جفت­باز بود. همچنین بالاترین درصد مشاهدات جمعیت بیمار مربوط به دسته ۰-۶  مگا جفت­باز بود (۸۱/۹۸ درصد) و کمترین درصد مشاهدات مربوط به دسته ۲۴-۴۸  مگا جفت­باز (۰۱/۰ درصد) بود. برای هتروزیگوسیتی، بالاترین درصد مشاهدات جمعیت سالم مربوط به دسته۰-۶  مگا جفت­باز (۹۹/۹۹ درصد) و کمترین درصد مشاهدات مربوط به دسته ۶-۱۲ مگا جفت­باز بود؛ در جمعیت بیمار، کمترین درصد مشاهدات در دسته ۶-۱۲ مگا جفت­باز و ۲۴-۴۸  مگا جفت­باز بود. در مجموع، جمعیت سالم، همخونی قدیمی تر، تعداد الگوی هموزیگوسیتی و هتروزیگوسیتی و همچنین میانگین طول الگوی هتروزیگوسیتی بیشتری نسبت به جمعیت بیمار داشت.

کلیدواژه ها:

الگوی هموزیگوسیتی ، الگوی هتروزیگوسیتی ، ضریب همخونی ژنومی ، نشانه انتخاب ، گوسفند آلپاین