مطالعهی ویژگی های پروتئینی و ساختار اگزون-اینترونی خانواده ژنی G۲-like در گیاه نخود با استفاده از ابزار های بیوانفوماتیکی

نخود (Cicer arietinum) یکی از مهمترین حبوبات در هزاران سال قبل با دلیالتامین پروتئین گیاهی و تثبیت نیتروژن، اهمیت زیادی دارد. این پژوهش به بررسی خانواده ژنی G۲LIKE در نخود و تحلیل ساختار ژنهای این خانواده با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی پرداخته است. اعضای خانواده ژنی G۲LIKE نقشهای کلیدی در تنظیم چرخه سلولی، تمایز سلولی، و پاسخ به تنشهای محیطی ایفا می کنند. برای شناسایی ویژگی های خانواده G۲LIKE در نخود، توالی های ژنومی و کدکننده از پایگاه داده Arabidopsis TAIR استخراج و با استفاده از ابزار tBlastn در سایت NCBI جستجو شد. توالی های پروتئینی شناسایی شده با استفاده از نرم افزار SMART برای یافتن دامینه های حفاظتی مورد بررسی قرار گرفتند و ژن ها با پیشوند "Ca" نامگذاری شدند. خصوصیات سلولی پروتئین ها با استفاده از نرم افزار WOLF و ویژگی های پروتئینی مانند طول، وزن مولکولی، و شاخص های pI و GRAVY با سرور ProtParam پیش بینی شد. برای تحلیل ساختار اگزون-اینترونی، توالی های ژنومی و CDS به فرمت FASTA ذخیره و با استفاده از نرم افزار GSDS بررسی شدند. نتایج نشان داد که طول پروتئین ها و وزن مولکولی آنها متنوع است و بیشتر ژن ها در حالت سلولی قرار دارند. بررسی ساختار اگزون-اینترونی نشان داد که ژن ها از نظر تعداد اگزون ها و اینترون ها تنوع زیادی دارند، به طوری که ژن های با بیشترین تعداد اگزون ها و اینترون ها ساختار پیچیده تری دارند و ممکن است نقش های مختلفی در تنظیم بیان ژن ایفا کنند. این مطالعه اطلاعات مفیدی برای بهبود ویژگی های زراعی نخود ارائه می دهد و می تواند به توسعه استراتژی های بهینه برای افزایش عملکرد و پایداری این گیاه کمک کند.

کلیدواژه ها:

ساختار ژن ، تنوع ژنتیکی ، G۲LIKE ، نخود ، تنشهای محیطی