شناسایی شبکه تنظیمی عمکردی miRNA-mRNA در سقط مکرر: آنالیز بیوانفورماتیکی پرزهای جفتی انسانی
سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 69
فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IJOGI-27-10_006
تاریخ نمایه سازی: 10 اسفند 1403
چکیده مقاله:
مقدمه: سقط خود به خودی مکرر (RSA)، یک اختلال تولیدمثلی است که مسئله حل نشده ای را در زنان ایجاد می کند. miRNAها ممکن است در تنظیم رشد جنین و حفظ بارداری نقش داشته باشند. مطالعه حاضر با هدف بررسی پروفایل miRNA در پرز جفتی زنان با سقط مکرر با مطالعات بیوانفورماتیکی انجام شد. روش کار: در این مطالعه، پروفایل بیانی mRNA و miRNA سلول های پرز جفتی از پایگاه GEO دریافت شدند. بعد از به دست آوردن هدف های miRNAهای دارای تغییر بیان، اشتراک این هدف ها با mRNAهای کاهشی/افزایشی به دست آمد. در مرحله بعد هویت شناسی ژنی (GO) و مسیرهای KEGG، برای ژن های مشترک انجام شد. شبکه میانکنش پروتئین- پروتئین و ژن های کلیدی مورد بررسی قرار گرفت. در نهایت شبکه تنظیمی miRNA-mRNA رسم شد. یافته ها: تعداد ۱۲۳ miRNA با تغییر بیان (۱۶ عدد کاهش بیان و ۱۰۷ عدد افزایش بیان) و ۶۷۰ ژن با تغییر بیان (شامل ۲۶۹ ژن کاهش بیان و ۳۶۶ ژن با افزایش بیان) آنالیز شدند. بعد از ایجاد اشتراک میان هدف های miRNAها و ژن های با تغییر بیان، ۲۱۹ ژن مشترک به دست آمد. نتایج آنالیز KEGG و GO نشان داد که ژن ها در مسیرهای پرولاکتین، اکسی توسین، تولید اینترلوکین ۶ و تمایز لوکوسیتی نقش دارند. همچنین در شبکه miRNA-mRNA ترسیم شده، miR-۵۴۸ap-۵p و miR-۳۲۰b با بیشترین امتیاز مشخص شدند. نتیجه گیری: مطالعه حاضر miRNAها و mRNAهای دارای تغییر بیان و همچنین ژن های کلیدی در سلول های پرز جفتی با RSA را شناسایی کرد. این مطالعه می تواند مارکرهای زیستی جدیدی را برای تشخیص یا درمان احتمالی RSA پیشنهاد کند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
یاس روحانی
دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه ژنتیک، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران.
سمیه رئیسی
دانشیار، گروه ژنتیک، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران.
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :