بررسی ژن های PR در مقاومت به شانکر اروپایی درختان سیب در راستای کاهش آلاینده های زیستی

آلودگی محیط زیست پدیده ای است که سالیان دراز زندگی انسان ها را تحت تاثیر قرار داده است. یکی از این عوامل استفاده بی رویه از قارچ کش های شیمیایی می باشد. در این میان بیماری شانکر درختان میوه در سیب با عامل بیماری زای Neonectria ditissima در بسیاری از کشورها به عنوان یک مشکل جدی اقتصادی مطرح است. امکان کنترل شیمیایی و بیولوژیکی محدود است وحذف درختان بیمار و آلوده پر زحمت و هزینه بر می باشد. در حال حاضر هیچ راهی برای از بین بردن قارچ از درختان آلوده وجود ندارد و دانش ما از روند آلودگی محدود است. این تحقیق به منظور بررسی الگوی بیان ژن های PR به این عامل بیماری زا در سیب انجام شد. رقم نیمه مقاوم سیب با سوسپانسیون قارچ تلقیح داده شد و نمونه های شاهد و تلقیح داده شده برای استخراج RNA مورد استفاده قرار گرفتند. سپس نمونه ها توالییابی شدند. بعد ازکنترل کیفیت داده ها، خوانش ها با ژنوم مرجع سیب نقشه یابی شدند و نرمال سازی و تجزیه و تحلیل ژن های با بیان متفاوت انجام شد. نتایج نشان داد ژن های مرتبط با پاتوژنز (PRs) در طی فرآیند مقاومت به عامل بیماری زا فعال شدند. به طوریکه BAK۱ ژن کد کننده پروتئین کیناز اختصاصی سرین/ترئونین (Leu-rich receptor serine/threonine protein kinase) افزایش بیان نشان داد. ژن BAK۱ یک ژن پیش از مرگ سلولی است و در سیستم دفاعی گیاهان می تواند دارای اهمیت باشد. همچنین ژن Bet v ۱ افزایش بیان داشت. این ژن متعلق به خانواده پروتئین های مرتبط با بیماری زایی (PR-۱۰) در گیاهان دو لپه ای است. این نتایج می تواند درک بهتر از تعامل بین میزبان و پاتوژن در جهت بهبود استراتژی های مدیریت به کار گرفته شود و درنهایت منجر به حداقل رساندن میزان استفاده از مواد شیمیایی خواهد شد، که این موضوع اهمیت شایانی در کمک به کاهش آلاینده های محیطی می شود.

کلیدواژه ها:

پاسخ دفاعی ، ایمنی زیستی ، نوترکیبی ، Neonectria ditissima