بررسی نقش ژن های Alk، PAH و CYP۱۵۳ در حذف آلاینده های قیر
محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 16، شماره: 4
سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 149
فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JOAGK-16-4_022
تاریخ نمایه سازی: 14 بهمن 1403
چکیده مقاله:
هدف: آلکان هیدروکسیلاز آنزیمی است که در مرحله اول تجزیه آلکان نقش دارد و ژن alkB برای تجزیه زیستی قیر مهم است زیرا قیر حاوی مقدار زیادی هیدروکربن مانند آلکان است، باکتری هایی با ژن alkane monooxygenase (AlkB) می توانند آن را تجزیه کنند. مکانیسم های تنظیمی می توانند پیچیده و مختص گونه باشند. آنزیم هایی وجود دارند که توسط ژن PAH کدگذاری شده اند که تجزیه هیدروکربن های آروماتیک چند حلقه ای (PAHs) را آغاز می کنند وPAH ها آلاینده های خطرناکی هستند که می توانند در آب و خاک شناسایی شوند. یک آلکان هیدروکسیلاز، به ویژه آنزیم سیتوکروم P۴۵۰، توسط ژن سیتوکروم P۴۵۰ کلاس I P۴۵۰ (CYP۱۵۳) کدگذاری می شود. این آنزیم برای تجزیه بیولوژیکی هیدروکربن ها، که شامل قیر است، ضروری است. آنزیم های متعلق به خانواده سیتوکروم P۴۵۰ نقش مهمی در متابولیسم بسیاری از ترکیبات مختلف، از جمله آن هایی که برای بدن خارجی هستند، ایفا می کنند. یکی از اجزای اصلی قیر، آلکان ها، می توانند توسط آنزیم CYP۱۵۳ اکسید شوند. بنابراین، هدف از این مطالعه بررسی نقش ژن هایAlk، PAH و CYP۱۵۳ در حذف آلاینده های قیر بود.مواد و روش ها: DNA ژنومی با استفاده از کیت استاندارد استخراج DNA استخراج شد. کیفیت و کمیت DNA استخراج شده با استفاده از دستگاه نانو دراپ تعیین شد. از پرایمرهای اختصاصی برای تکثیر ژن های AlkB، PAHs و Cyp۱۵۳ استفاده شد. مشاهده قطعات تکثیر شده با استفاده از ترانس ایلمیناتور در زیر نور ماوراء بنفش انجام و عکسبرداری شد.نتایج: DNA استخراج شده کیفیت و کمیت خوبی (۱۰ng/μL) داشت. آلکان منواکسیژناز (alkB)، PAH و CYP۱۵۳ سه ژن کلیدی کدکننده آنزیم هستند که به ترتیب نقش اساسی در کانی سازی مواد شیمیایی آلیفاتیک و PAH دارند. حضور این سه ژن (alkB، PAH و CYP۱۵۳) بر اساس تکثیر PCR شناسایی و روی ژل آگارز مشاهده شد. فراوانی ژن های استفاده کننده از قیر متفاوت بود. بالاترین فراوانی برای ژن CYP۱۵۲ و کمترین فراوانی برای ژن AlkB بود.نتیجه گیری: نتایج پتانسیل کاربردهای زیست پالایی را به ویژه در مناطق آلوده به قیر با استفاده از باکتری های بومی مانند سودوموناس آئروژینوزا برای تایید اثربخشی این باکتری ها در محیط های عملی و ایجاد تکنیک های زیست پالایی مقیاس پذیر برای کاهش آلودگی هیدروکربنی نشان می دهد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
ذحی مجید حسونی
مرکز ملی آزمایشگاه ها و تحقیقات ساختمانی، آزمایشگاه ساختمانی واسط، الکوت، واسط، عراق.
ملاد خلف محمد
گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه واسط، عراق.
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
