piRNA های دارای افتراق بیان در سلول های سرطان سینه

سرطان سینه شایع ترین سرطان زنان می باشد که علیرغم پیشرفتهای علمی زیاد همچنان علت اصلی مرگ و میر ناشی از سرطان در بین زنان محسوب می شود. برای حل این معضل جهانی نیازمند مطالعات مولکولی عمیق تری در حوزه سرطان سینه هستیم. امروزه نقش piRNAها بعنوان تنظیم کننده بیان ژن ها در سرطان های مختلف مورد توجه بسیاری قرار گرفته است. در این مطالعه هدف ما شناسایی piRNAهای مهم درگیر در سرطان سینه و ژن های هدف آن ها می باشد. برای این منظور داده های RNA seq small خام مربوط به نمونه های بافت سرطان سینه و بافت نرمال سینه از پایگاه داده GEO انتخاب و استخراج شد و از پلتفرم Galaxy برای آنالیز بیوانفورماتیکی آن ها استفاده شد. بیان افتراقی ۳۷۲ عدد piRNA بر اساس Log۲ FC ≥ ۲، p. value ≤ ۰.۰۵ بدست آمد که ۱۹۱ عدد افزایش بیان و ۱۸۱ عدد کاهش بیان معنی دار را نشان دادند. بیشترین افزایش مربوط به hsa-piR-۳۳۱۲۵ می باشد که هدف آن GATAD۲A می باشد و در پروسه های سرطانزایی از قبیل توسعه عروق خونی، آپاپتوز، تنظیم بیان ژن در سطح رونویسی و ... نقش دارد. بیشترین کاهش مربوط به hsa-piR-۳۳۰۷۳ با Log۲ FC= -۴.۲۰ می باشد. پیدا کردن لیستی از piRNAهای مهم که افتراق بیان معنی دار در سرطان سینه نسبت به بافت نرمال دارند و همچنین مشخص کردن افزایش و یا کاهش بیان آن ها در بافت سرطانی و تشخیص ژن های هدف و بررسی نقش آن ها در مسیرهای بیولوژیکی دخیل در توسعه و پیشرفت سرطان، می تواند آغازگر مطالعاتی باشد که در نهایت منجر به پیشرفت در تحقیقات سرطان سینه و روش های درمانی شود.

کلیدواژه ها:

breast cancer ، piRNA ، differential expression ، small RNA seq ، molecular studies ، سرطان سینه ، piRNA ، بیان افتراقی ، small RNA seq ، مطالعات مولکولی