ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

مطالعه ارتباط ژنومی برای شناسایی ژن های کاندیدا در مراحل اولیه رشد در مرغ

محل انتشار: فصلنامه علوم دامی ایران، دوره: 55، شماره: 4
سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 166

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/2158347

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJAS-55-4_004

تاریخ نمایه سازی: 1 بهمن 1403

چکیده مقاله:

تاکنون روش­های متعددی برای شناسایی فاکتورهای ژنتیکی موثر بر صفات پلی­ژنیک مورداستفاده قرارگرفته است. روش های رایج استفاده شده شامل آنالیز رگرسیونی مبتنی بر حداقل مربعات، آنالیز رگرسیونی مبتنی بر حداکثر درست نمایی و روش های بیزی می باشد. از برتری روش های بیزین نسبت به سایر روش ها می توان به امکان استفاده هم زمان از کل مارکرها در مدل اشاره نمود که منجر به جلوگیری از بیش برآورد اثرات نشانگرها شده و احتمال شناسایی SNPهای مثبت واقعی را افزایش می دهد. ازاین رو، در مطالعه حاضر برای شناسایی SNPهای مرتبط با وزن بدن در سنین اولیه (۲ هفتگی)، در یک جمعیت F۲ از مرغان آمیخته، از روش بیز Cpi استفاده شد. سپس، برای تعیین ژنوتیپ جمعیت حاضر شامل ۳۱۲ مرغ F۲، چیپ های تجاریIllumina ۶۰K  استفاده گردید. درنهایت، ۱۶ مارکر SNP که دارای فاکتور بیز بین ۲۰ تا ۱۵۰ بودند، به عنوان مارکرهای پیشنهادی برای وزن بدن در این سن در نظر گرفته شد. این SNPها بر روی ۴ کروموزوم توزیع شده اند و به صورت سببی و یا به واسطه وجود عدم تعادل پیوستگی با ۱۶ ژن ارتباط نزدیک دارند. از ژن­های شناسایی شده ۱۲ ژن، کد کننده پروتئین و ۴ ژن RNA غیرکدکننده می باشند. برای شناسایی ژن های مرتبط با هر SNP در مناطق کاندیدا، Mb ۵/۰ اطراف هر SNP معنی­دار در نظر گرفته شد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

زینب عسگری

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

علیرضا احسانی

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران.

علی اکبر مسعودی

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران.

رسول واعظ ترشیزی

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Ahsan, M. (۲۰۱۴). Mapping and functional characterization of candidate genes ...
  • Asgari, Z., Ehsani, A., Masoudi, A.A, and Vaez Torshizi, R. ...
  • Baumkötter, F., Schmidt, N., Vargas, C., Schilling, S., Weber, R., ...
  • Cadigan, K.M, and Liu, Y.I. (۲۰۰۶). Wnt signaling: complexity at ...
  • Cai, L., Fritz, D., Stefanovic, L. and Stefanovic, B. (۲۰۱۰). ...
  • Carlborg, Ö, Hocking, P.M., Burt, D.W, and Haley, C.S. (۲۰۰۴) ...
  • Carlborg, Ö., Kerje, S., Schütz, K., Jacobsson, L., Jensen, P. ...
  • Cappai, R., Cheng, F., Ciccotosto, G.D., Needham, B.E., Masters, C.L., ...
  • Clevers, H. (۲۰۰۶). Wnt/β-catenin signaling in development and disease. Cell, ...
  • Cook, B.D., Dynek, J.N., Chang, W., Shostak, G. and Smith, ...
  • Costa, R.B., Camargo, G.M., Diaz, I.D., Irano, N., Dias, M.M., ...
  • Emrani, H. (۲۰۱۶). Genome Wide Association Study(GWAS) for Growth traits ...
  • Filali, M., Cheng, N., Abbott, D., Leontiev, V. and Engelhardt, ...
  • Fu, Y., Westenbroek, R.E., Scheuer, T. and Catterall, W.A. (۲۰۱۴). ...
  • Gaudet, P., Livstone, M.S., Lewis, S.E, and Thomas, P.D. (۲۰۱۱). ...
  • Goddard, M.E, and Hayes, B.J. (۲۰۰۹). Mapping genes for complex ...
  • He, X., Semenov, M., Tamai, K. and Zeng, X. (۲۰۰۴). ...
  • Kadir, R., Harel, T., Markus, B., Perez, Y., Bakhrat, A., ...
  • Kang, H.M., Sul, J.H., Service, S.K., Zaitlen, N.A., Kong, S.Y., ...
  • Kass, R.E, and Raftery, A.E. (۱۹۹۵). Bayes factors. Journal of ...
  • Kim, K., Jung, J., Caetano-Anolles, K., Sung, S., Yoo DAhn, ...
  • Kerje, S., Carlborg, Ö., Jacobsson, L., Schütz, K., Hartmann, C., ...
  • Kitamoto, Y., Yuan, X., Wu, Q., McCourt, D.W, and Sadler, ...
  • Ledur, M., Navarro, N. and Pérez-Enciso, M. (۲۰۱۰). Large-scale SNP ...
  • Li, X., Liu, P., Liu, W., Maye, P., Zhang, J., ...
  • Lin, R.-Y., Vera, J.C., Chaganti, R.S, and Golde, D.W. (۱۹۹۸). ...
  • Ma, Y., Gu, L., Yang, L., Sun, C., Xie, S., ...
  • Madsen, P. and Jensen, J. (۲۰۰۲). A package for analysing ...
  • Maher, B. (۲۰۰۸). Personal genomes: The case of the missing ...
  • Nystoriak, M.A., Nieves-Cintrón, M., Patriarchi, T., Buonarati, O.R., Prada, M.P., ...
  • Peters, S., Kizilkaya, K., Garrick, D., Fernando, R., Reecy, J., ...
  • Rorsman, P. (۲۰۰۵). Insulin secretion: function and therapy of pancreatic ...
  • Sewalem, A., Morrice, D.M., Law, A., Windsor, D., Haley, C.S., ...
  • Splawski, I., Timothy, K.W., Sharpe, L.M., Decher, N., Kumar, P., ...
  • Su, Z.-J., Hahn, C.N., Goodall, G.J., Reck, N.M., Leske, A.F., ...
  • Team, R.C., ۲۰۱۸. R: A Language and environment for Statistical ...
  • Uaesoontrachoon, K., Yoo, H.-J., Tudor, E.M., Pike, R.N., Mackie, E.J, ...
  • Van Kaam, J., Van Arendonk, J., Groenen, M., Bovenhuis, H., ...
  • Saravanan, K., Panigrahi, M., Kumar, H., Bhushan, B., Dutt, T. ...
  • Varona Aguado, L., García Cortés, L.A, and Perez Enciso, M. ...
  • Walugembe, M., Bertolini, F., Dematawewa, C.M.B., Reis, M.P., Elbeltagy, A.R., ...
  • Wang, S., Hu, X., Wang, Z., Li, X., Wang, Q., ...
  • Weng, Z., Xu, Y., Li, W., Chen, J., Zhong, M., ...
  • Williams, J., Xu, S. and Ferreira, M.A. (۲۰۲۳). BGWAS: Bayesian ...
  • Wolc, A. and Dekkers, J.C. (۲۰۲۲). Application of Bayesian genomic ...
  • Xie, L., Luo, C., Zhang, C., Zhang, R., Tang, J., ...
  • Xu, Y.p., Liang, L. and Wang, X.M. (۲۰۱۱). The levels ...
  • Yamashina, I. (۱۹۵۶). The action of enterokinase on trypsinogen. BBA. ...
  • Zhang, Y., Liu, S., Mickanin, C., Feng, Y., Charlat, O., ...
    • نمایش کامل مراجع