Fonsecazyma quercina sp. nov., a novel yeast species isolated from Persian oak (Quercus brantii) branch in Iran

سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 96

فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ROST-25-2_002

تاریخ نمایه سازی: 9 دی 1403

چکیده مقاله:

A taxonomic study of yeast isolates collected from the Persian oak (Quercus brantii) branch in the Zagros oak forests (Kermanshah Province, West of Iran) revealed the presence of a novel yeast species. Morphological and physiological characteristics, as well as sequence analysis of the D۱/D۲ region of the large subunit rRNA gene and the internal transcribed spacer region, showed that, the novel species belonged to the genus Fonsecazyma (Tremellales, Bulleraceae). The name Fonsecazyma quercina sp. nov. is proposed for this new species. This novel species has the highest sequence similarity with Fonsecazyma sp. KT۳۰۱ (۹۷.۵۸%). This isolate comprises spherical single cells and can grow in NaCl concentrations up to ۱ M. It can thrive at pH levels of ۴, ۸, and ۱۰ but not at a pH of ۲. The isolate is psychrotolerant, exhibiting optimal growth between ۶ and ۲۵ °C but unable to grow outside of this temperature range. Regarding carbon sources, the isolate efficiently utilizes and assimilates glucose and trehalose. It also can utilize sucrose, mannose, maltose, and fructose to some extent but shows weak utilization of cellobiose, sorbitol, and rhamnose. However, this isolate cannot utilize galactose, sorbose, lactose, melibiose, arabinose, ribose, or glycine as sole carbon sources. The holotype of Fonsecazyma quercina sp. nov. was deposited at the Fungus Reference Collection of Herbarium Ministerii Iranici Agriculturae (IRAN) as an inactive form.

نویسندگان

آرمین قبادی

MSc Student in Plant Pathology, Department of Plant Protection, College of Agriculture, Razi University, Kermanshah, Iran

صمد جمالی

Associate Prof., Department of Plant Protection, College of Agriculture, Razi University, Kermanshah, Iran

سامان حسینی

MSc Graduate in Plant Pathology, Department of Plant Protection, College of Agriculture, Razi University, Kermanshah, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Alcaíno, J., Cifuentes, V. & Baeza, M. ۲۰۱۵. Physiological adaptations ...
  • Boekhout, T., Amend, A.S., El Baidouri, F., Gabaldón, T., Geml, ...
  • Borkar, S.G. ۲۰۱۸. Laboratory Techniques in Plant Bacteriology, CRC Press. ...
  • Brink, B. ۲۰۱۰. Urease test protocol. American Society for Microbiology ...
  • Bulgari, R., Trivellini, A. & Ferrante, A. ۲۰۱۹. Effects of ...
  • Carrasco, M., Rozas, J.M., Barahona, S., Alcaíno, J., Cifuentes, V. ...
  • Castresana, J. ۲۰۰۰. Selection of conserved blocks from multiple alignments ...
  • Christensen, W.B. ۱۹۴۶. Urea decomposition as a means of differentiating ...
  • Corte, L., Rellini, P., Lattanzi, M., Picchetta, C., Fatichenti, F. ...
  • Fell, J.W., Boekhout, T., Fonseca, A., Scorzetti, G. & Statzell-Tallman, ...
  • Felsenstein, J. ۱۹۸۵. Confidence limits on phylogenies: an approach using ...
  • Findley, K., Rodriguez-Carres, M., Metin, B., Kroiss, J., Fonseca, A., ...
  • Golubev, W.I., Pfeiffer, I. & Tomashevskaya, M.A. ۲۰۰۸. Cryptococcus pinus ...
  • Hanane, T., Najoua, B., Salsabil, H., Abdellatif, J.I., Dalila, B., ...
  • Kumar, D., Kumar, L., Nagar, S., Raina, C., Parshad, R. ...
  • Kurtzman, C.P., Fell, J.W., Boekhout, T. & Robert, V. ۲۰۱۱. ...
  • Kurtzman, C.P., Mateo, R.Q., Kolecka, A., Theelen, B., Robert, V. ...
  • Kurtzman, C.P. & Robnett, C.J. ۱۹۹۸. Identification and phylogeny of ...
  • Lachance, M.A. ۲۰۰۶. Yeast Biodiversity: How Many and How Much?. ...
  • Landell, M.F., Inacio, J., Fonseca, A., Vainstein, M.H. & Valente, ...
  • Li, A.-H., Yuan, F.X., Groenewald, M., Bensch, K., Yurkov, A.M., ...
  • Liu, X.-Z., Wang, Q.M., Göker, M., Groenewald, M., Kachalkin, A., ...
  • Liu, X.-Z., Wang, Q.M., Theelen, B., Groenewald, M., Bai, F.-Y. ...
  • of tremellomycetous yeasts and related dimorphi ...
  • and filamentous basidiomycetes reconstructed from multiple gene sequence analyses ...
  • Studies in Mycology ۸۱: ۱–۲۶. DOI: ۱۰.۱۰۱۶/j.simyco.۲۰۱۵.۰۸.۰۰۱ ...
  • Maharana, A.K. & Ray, P. ۲۰۱۳. Isolation and screening of ...
  • Margesin, R., Neuner, G. & Storey, K. ۲۰۰۷. Cold-loving microbes, ...
  • Mašínová, T., Yurkov, A. & Baldrian, P. ۲۰۱۸. Forest soil ...
  • Mekonnen, E., Kebede, A., Nigussie, A., Kebede, G. & Tafesse, ...
  • Middelhoven, J. & Kurtzman, C.P. ۲۰۰۳. Relation between phylogeny and ...
  • Mishra, S. & Behera, N. ۲۰۰۸. Amylase activity of a ...
  • Morais, P.B., Pagnocca, F.C. & Rosa, C.A. ۲۰۰۶. Yeast Communities ...
  • Nakase, T., Jindamorakot, S., Am-In, S., Potacharoen, W. & Tanticharoen, ...
  • Nei, M. & Kumar, S. ۲۰۰۰. Molecular Evolution and Phylogenetics, ...
  • Ramnath, L., Sithole, B. & Govinden, R. ۲۰۱۷. Identification of ...
  • Russell, N.J. ۲۰۰۶. Antarctic microorganisms: coming in from the cold. ...
  • Satoh, K., Maeda, M., Umeda, Y., Sugamata, M. & Makimura, ...
  • Schaad, N.W., Jones, J.B. & Chun, W. ۲۰۰۱. Laboratory Guide ...
  • Schoch, C.L., Seifert, K.A., Huhndorf, S., Robert, V., Spouge, J.L., ...
  • Scorzetti, G., Fell, J., Fonseca, A. & Statzell-Tallman, A. ۲۰۰۲. ...
  • Shin, K.-S., Oh, H.-M., Park, Y.-H., Lee, K.H., Poo, H., ...
  • Singh, P., Tsuji, M., Singh, S. M., Roy, U. & ...
  • Statzell-Tallman, A., Belloch, C. & Fell, J.W. ۲۰۰۸. Kwoniella mangroviensis ...
  • Strauss, M., Jolly, N., Lambrechts, M. & Van Rensburg, P. ...
  • Thomas-Hall, S.R., Turchetti, B., Buzzini, P., Branda, E., Boekhout, T., ...
  • Vu, D., Groenewald, M., Szöke, S., Cardinali, G., Eberhardt, U., ...
  • Studies in Mycology ۸۵(۱): ۹۱–۱۰۵. DOI: ۱۰.۱۰۱۶/j.simyco.۲۰۱۶.۱۱.۰۰۷ ...
  • Wang, G.S., Zhou, Y., Xue, L., Li, A.H., Wangmu & ...
  • Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology ۷۰(۱۰): ۵۳۹۴–۵۴۰۰. DOI: ۱۰.۱۰۹۹/ijsem.۰.۰۰۴۴۲۳ ...
  • Wang, Q.M., Wang, S.A., Jia, J.H. & Bai, F.Y. ۲۰۰۷. ...
  • White, T.J., Bruns, T., Lee, S. & Taylor, J. ۱۹۹۰. ...
  • نمایش کامل مراجع