Genetic variation among different populations of Centaurea virgata from Iran using start codon targeted (SCoT) markers
محل انتشار: دوفصلنامه رستنیها، دوره: 25، شماره: 2
سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 49
فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_ROST-25-2_005
تاریخ نمایه سازی: 9 دی 1403
چکیده مقاله:
The aim of the present study is the identification of the genetic variation of Centaurea virgata (Asteraceae) through start codon targeted (SCoT) markers. Forty-two specimens of said species were collected from ۱۱ different regions of Iran. Ten primers revealed ۱۳۱ amplifications ranging from ۲۰۰ bp to ۳ kbp, of which ۱۰۲ (۷۷.۸۶%) were polymorphic. Polymorphism information content (PIC) ranged from ۰.۳۷ to ۰.۵۰ with an average of ۰.۴۳, effective multiplex ration (EMR) from ۱ to ۴.۱۱ and marker index (MI) from ۰.۰۰۶ to ۰.۵۹. Based on the analysis of molecular variance (AMOVA), the genetic variation within populations (۷۲%) was higher than that of those among populations (۲۸%). Overall, the highest mean for Nei’s gene diversity (۰.۱۸), Shannon index (۰.۲۷) and percentage of polymorphic loci (۴۷.۸۳) were observed in W. Azarbaijan populations, similarly the highest mean of total heterozygosity (HT) and subpopulation heterozygosity (HS) were found to be ۰.۱۸ and ۰.۰۷ in W. Azarbaijan and Golestan populations, respectively. The high genetic differentiation (GST = ۱) showed significant genetic variation in Razavi Khorasan, N. Khorasan, Kurdistan, and Hamedan populations. Neighbor-Joining and population structure analysis divided C. virgata populations into six main clusters. The current study showed that, SCoT marker was efficient in assessing the genetic variation among different populations of the studied species.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
الهه قاسمی
MSc Graduate in Biochemistry, Department of Cell and Molecular Biology, Faculty of Chemistry, University of Kashan, Kashan, Iran
زینب طلوعی
Assistant Prof., Department of Cell and Molecular Biology, Faculty of Chemistry, University of Kashan, Kashan, Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :