مقایسه کارآیی نانوذرات مغناطیسی آهن با روش های CTAB و تشخیص سریع برای استخراج DNA از گلبرگ گل سرخ رقم "Vendetta"

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 1

فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_BIOT-10-4_001

تاریخ نمایه سازی: 5 دی 1403

چکیده مقاله:

استخراج DNA با کیفیت و کمیت عالی برای بسیاری از مطالعات بیولوژی مولکولی ضروری است. DNA استخراج شده از بافت گلبرگ به خاطر محتوای فراوان متابولیت ‎های ثانویه از کمیت و کیفیت مطلوبی برخوردار نیست. کاروتنوئیدها، آنتوسیانین ها، فنولیک اسیدها و فلاونوئیدها، موثرترین متابولیت های ثانویه موجود در گلبرگ به عنوان آلودگی در نظر گرفته می شوند و در فرآیند استخراج و تخلیص DNA اختلال ایجاد می نمایند. با توجه به این که مبنای بسیاری از تحقیقات مولکولی در مهندسی ژنتیک و ژنومیکس، وجود DNA با کیفیت بالا است، بنابراین یافتن روشی کارآمد برای کاهش اثرات منفی این ترکیبات در فرآیند استخراج ضروری به نظر می رسد. در همین راستا نانوذرات مغناطیسی آهن برای بهبود استخراج DNA با کمیت و کیفیت عالی از بافت گلبرگ گل سرخ در این پژوهش استفاده شده است. در ادامه به منظور مقایسه کارآیی استخراج DNA، از روش های ستیل تری متیل اتیل آمونیوم بروماید (CTAB) بهینه شده و روش تشخیص سریع استفاده شد. نتایج نشان داد که کمیت و کیفیت DNA استخراج شده از گلبرگ با استفاده از روش نانوذرات مغناطیسی آهن در مقایسه با دو روش دیگر قابل اعتمادتر بود. علاوه براین، این روش قادر به استخراج مقدار مطلوب DNA، با کمترین میزان نمونه در طی چند دقیقه است. با توجه به کیفیت وکمیت DNA استخراج شده با نانوذرات مغناطیسی آهن، این روش به عنوان یک پروتکل کارآمد برای استخراج DNA از گلبرگ گل سرخ توصیه می شود.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

فائزه خاتمی

Ph.D. Student of Plant Physiology, Department of Plant Sciences, Faculty of Biological Sciences, Kharazmi University, Postal Code: ۱۵۷۱۹۱۴۹۱۱, Tehran, Iran.

فرزانه نجفی

Associate Professor, Department of Plant Sciences, Faculty of Biological Sciences, Kharazmi University, Postal Code: ۱۵۷۱۹۱۴۹۱۱, Tehran, Iran.

فتانه یاری

Assistant Professor, Department of Agriculture, Iranian Research Organization for Science and Technology (IROST), Postal Code: ۳۳۵۳۵۱۱۱, Tehran, Iran.

رمضانعلی خاوری نژاد

Professor, Department of Plant Sciences, Faculty of Biological Sciences, Kharazmi University, Postal Code: ۱۵۷۱۹۱۴۹۱۱, Tehran, Iran; and Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Narayanan, C., Dubey, S., Wali, S.A., Shukla, N., Kumar, R., ...
  • Amani, A.L, and Gamal, O. (۲۰۱۷) Comparison of three genomic ...
  • Dehestani, A., and Kazemi Tabar, S.K. (۲۰۰۷) A rapid efficient ...
  • Sahu, S.K., Thangaraj, M., and Kathiresan, K. (۲۰۱۲) DNA extraction ...
  • Kumar, V., Prasad, A., Roy, C., and Chattopadhyay, T. (۲۰۱۸) ...
  • Varma, A., Padh, H., and Shrivastava, N. (۲۰۰۷) Plant genomic ...
  • Tan, S.C., and Yiap, B.C. (۲۰۰۹) DNA, RNA, and protein ...
  • Khan, I.A., Awan, F.S., Ahmad, A., and Khan, A.A. (۲۰۰۴) ...
  • Lutz, K.A., Wang, W., Zdepski, A., and Michael, T.P. (۲۰۱۱) ...
  • Xu, Q., Wen, X., and Deng, X. (۲۰۰۴) A simple ...
  • Cheng, Y.J., Guo, W.W., Yi, H.L., Pang, X.M., and Deng, ...
  • Inga, G., Tamara, K., Boris, V., Marina, K., and Nelly, ...
  • Stefanova, P., Taseva, M., Georgieva, T., Gotcheva, V., and Angelov, ...
  • Amani, J., Kazemi, R., Abbasi, A.R., and Salmanian, A.H. (۲۰۱۱) ...
  • Nematzadeh, G.A., Ghahari, S., and Ghahari, S.A. (۲۰۱۵) Production of ...
  • Cai, B., Zhang, J., Gao, Z., Qu, S., Tong, Z., ...
  • Olgunsoy, P., Seyhan, U., and Ufuk, C.A. (۲۰۱۷) Metabolite Production ...
  • Yu, D., Tang, H., Zhang, Y., Du, Z., Yu, H., ...
  • Klie, M., and Debener, T. (۲۰۱۱) Identification of superior reference ...
  • Zhang, Z.C., Cui, Y., and Qian-Hong, W. (۲۰۰۷) Surface modification ...
  • Kudr, J., Haddad, Y., Richtera, L., Heger, Z., Cernak, M., ...
  • Berensmeier, S. (۲۰۰۶) Magnetic particles for the separation and purification ...
  • نمایش کامل مراجع