کاربرد نشانگر ISSR جهت ارزیابی تنوع ژنتیکی بین و درون گونه ای چاودار

سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 145

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_BIOT-12-3_005

تاریخ نمایه سازی: 5 دی 1403

چکیده مقاله:

چاودار یکی از گیاهان زراعی مهم ایران با نام علمی  Secaleمتعلق به خانواده گندمیان (Poaceae) می­باشد. در این پژوهش تنوع ژنتیکی ۳۹ جمعیت چاودار از مناطق مختلف ایران، آمریکا و شوروی با نشانگر ISSR مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج بدست آمده نشان داد که ۸ آغازگر ISSR ۴۸ باند تولید کردند که شامل ۱۸ باند چندشکل (۵/۳۷ درصد چندشکلی) بود. میانگین میزان اطلاعات چندشکلی (PIC) ۱۵/۰ و شاخص نشانگر (MI) در آغازگرهای ISSR  معادل ۷/۲ عدد بود. بیشترین مقدار PIC (۳/۰) مربوط به آغازگر ۶+۵ و بیشترین MI (۹۶/۰) مربوط به آغازگر ۶+۱ بود. پس از مشاهده محصول­های واکنش زنجیره­ای پلیمراز بر روی ژل آگارز و امتیازدهی باندهای DNA، تجزیه و تحلیل با نرم­افزار NTSYS انجام شد. دندروگرام تجزیه خوشه­ای با روش UPGMA و ضریب تشابه جاکارد جمعیت­های چاودار را به ۹ گروه تقسیم کرد که نتایج گروه­بندی آن با گروه­بندی تجزیه مولفه­های اصلی مطابقت داشت. نتایج تجزیه واریانس مولکولی بیانگر تنوع درون گونه­­ای بیشتر از تنوع بین گونه­ای بود. میانگین تنوع ژنی نی (h) ۳۵۰/۰ و میانگین شاخص شانون (I) در گونه­های چاودار ۵۲۳/۰ بود که بیانگر تنوع خوب درون گونه­ها می­باشد. نتایج نشان داد که نشانگر ISSR ابزار مفیدی در تعیین تنوع ژنتیکی درون و بین گونه­ای چاودار است.

نویسندگان

الهام رضایی میرقائد

Biotechnology Department, Agriculture Faculty, University of Payam Noor, Isfahan, Isfahan, Iran

رسول امیریان

Department of genomics, Branch of Central Region (Isfahan), Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII), Agricultural Research, Extension and Education Organization of Iran (AREEO), Isfahan, Iran

ایمان آرضی

Department of genomics, Branch of Central Region (Isfahan), Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII), Agricultural Research, Extension and Education Organization of Iran (AREEO), Isfahan, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Mazaheri D. Mixture agronomy. Tehran: Publishing Center of Tehran University; ...
  • NourMohammadi Gh, Siadat SA, Kashani A. Cereals agronomy. Ahvaz: Publishing ...
  • Arzani A. Breeding of crops plants. Isfahan: Publishing Center of ...
  • Pradeep Reedy M, Salar N, Siddiq EA. Inter Simple Sequence ...
  • Cwiklinska A, Broda Z. The usefulness of RAPD and AFLP ...
  • Emel S. Evaluation of ISSR markers to assess genetic variability ...
  • Gradzielewska A. Biodiv. Application of the ISSR method to estimate ...
  • Magdalena A, Kalinka, A. Assessment of genetic relationships among Secale ...
  • Rogers SO, Bendich AJ. Extraction of total cellular DNA from ...
  • Vos P, Hogers R, Bleeker M, Reijans M, Van de ...
  • Lewonton RC. The apportionment of human diversity. Evolutionary Biology. ۲۰۰۹;۶:۳۸۱-۳۹۸ ...
  • Nei M. Analysis of gene diversity in subdivided populations. In: ...
  • Peakall R, Smouse PE. GENALEX ۶: genetic analysis in Excel. ...
  • Slatkin M and Barton N (۱۹۸۹). A comparison of three ...
  • Farshadfar AA. Application of Quantitative Genetic in Plant Breeeding, Volume ...
  • Rohlf M. NTSYS-pc. Numerical taxonomy and multivariate analysis system. Version ...
  • Schaut JW, Qi X, Stam P. Association between relationship measures ...
  • نمایش کامل مراجع