تخلیص RBDژن اسپایک ویروس ۲ SARS-COV-بیان شده در سلول پروکاریوتی و بررسی تمایل اتصال پپیتدهای ضدویروسی به این پروتئین با استفاده از مطالعات بیوانفورماتیکی

سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 3

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_BIOT-15-3_001

تاریخ نمایه سازی: 5 دی 1403

چکیده مقاله:

همه گیری کرونا و مرگ شمار کثیری از انسان ها در جهان، شرایط اجتماعی و اقتصادی کشورها را با خطر روبرو کرده است. ویروس SARS-CoV-۲ از خانواده کرونا ویرویده، عامل بیماری کرونا و مسبب شیوع آن در قرن اخیر است.  به دلیل استفاده ویروس کرونای جدید از پروتئین اسپایک سطح خود برای ورود به سلول های میزبان و اتصال به پروتئین سطحی ACE۲  برای ورود ماده ژنتیکی و عفونت زایی،  مطالعه ناحیه اتصال به گیرنده (RBD) در پروتئین اسپایک برای دانشمندان بسیار مهم است؛ با مهار این پروتئین و ناحیه اتصال به گیرنده آن ، می توان مانع از ورود ویروس به سلول شد. با استفاده از کلونینگ می توان ژن های این ویروس را تکثیر و پروتئین آن را خالص سازی کرد. بکارگیری پپتیدهای ضدویروسی  برای درمان بیماری ها یکی از روش های بسیار کاربردی است و در درمان SARS-CoV-۲، پپتیدهای ممانعت کننده از اتصال RBD به گیرنده ACE۲ ،بسیار مورد توجه دانشمندان است. در تحقیق حاضر، کلونینگ RBD در وکتور بیانی PET۲۸a، بیان پروتئین RBD و فیوژن پروتئین GFP/RBD در میزبان پروکاریوتی انجام شد. به دلیل محلول نبودن این پروتئین در میزبان پروکاریوت ، Column Refolding با شیب اوره با ستون نیکل-آگارز انجام و  پروتئین سنتز شده از طریق تکنیک وسترن بلات تایید شد. از مقالات سه پپتید برای مقایسه اتصال آن ها با RBD با استفاده از بیوانفورماتیک کاندید و تمایل اتصالشان به همدیگر با روش داکینگ مولکولی بررسی و مشخص شد می توان از پپتیدهای یاد شده به دلیل اتصال به RBD در صورت تایید میانکش بین آن ها در درمان عفونت این ویروس استفاده کرد.

نویسندگان

مجید صادقی زاده

Professor of Genetics, School of Biological Sciences, Tarbiat Modares University.Tehran/Iran

نرگس معززی طهران خواه

Department of Genetics, Faculty of Biological Sciences, Tarbiat Modares University

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Cui J, Li F, Shi Z-L. Origin and evolution of ...
  • Zhu N, Zhang D, Wang W, Li X, Yang B, ...
  • Zhou P, Yang X-L, Wang X-G, Hu B, Zhang L, ...
  • Walls AC, Tortorici MA, Bosch B-J, Frenz B, Rottier PJ, ...
  • Shajahan A, Archer-Hartmann S, Supekar NT, Gleinich AS, Heiss C, ...
  • Wan Y, Shang J, Graham R, Baric RS, Li F. ...
  • Agarwal G, Gabrani R. Antiviral peptides: identification and validation. International ...
  • Chew M-F, Poh K-S, Poh C-L. Peptides as therapeutic agents ...
  • Lee AC-L, Harris JL, Khanna KK, Hong J-H. A comprehensive ...
  • Papanikolaou V, Chrysovergis A, Ragos V, Tsiambas E, Katsinis S, ...
  • Zimmer M. Green fluorescent protein (GFP): applications, structure, and related ...
  • Song HC, Seo M-Y, Stadler K, Yoo BJ, Choo Q-L, ...
  • Chi XS, Landt Y, Crimmins DL, Dieckgraefe BK, Ladenson JH. ...
  • Barbas ۳rd C, Kang AS, Lerner RA, Benkovic SJ. Assembly ...
  • Groves D, Morris B. Veterinary sources of nonrodent monoclonal antibodies: ...
  • نمایش کامل مراجع