بررسی تنوع ژنتیکی برخی از گونه های بنفشه ایرانی (.Viola sp) با استفاده از نشانگر مولکولی iPBS

سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 75

نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_PGRLU-11-1_001

تاریخ نمایه سازی: 13 آذر 1403

چکیده مقاله:

گیاه بنفشه (.sppViola ) متعلق به خانواده بنفشگان ازجمله گیاهان زینتی است که به دلیل داشتن ترکیبات سیکلوتیدی در طراحی و ساخت داروها قابل استفاده است. در این پژوهش از ۲۱ اکوتیپ مختلف بنفشه از مناطق شمالی ایران نمونه برداری شد و بعد از استخراج DNA، با استفاده از نشانگر مولکولی iPBS مورد ارزیابی تنوع ژنتیکی قرار گرفتند. بر اساس نتایج به دست آمده، در مجموع ۲۱۴ نوار برای نشانگر iPBS حاصل شد. میانگین درصد چندشکلی مشاهده شده، محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC) و شاخص نشانگر (MI) به ترتیب ۹۲.۳۱ درصد، ۰.۳۵ درصد و ۵.۶۴ محاسبه شد. مقادیر شاخص فاصله ژنتیکی Nei نیز بین صفر و ۰.۶۶ قرار داشت. نتایج حاصل از این پژوهش بیانگر تنوع ژنتیکی قابل توجه بین اکوتیپ ­های بنفشه ایران است و به­ نظر می­رسد که استفاده از نشانگر iPBS برای ارزیابی تنوع ژنتیکی در این گونه مناسب باشد. نتایج مربوط به تجزیه و تحلیل­ های بین گونه ای و درون گونه ای نشان داد که ۶۱ درصد از تنوع مربوط به تنوع درون گونه ای است. بیشترین میزان پلی مورفیسم (چندشکلی)، تعداد آلل، تعداد آلل موثر، شاخص شانون و نسبت هتروزیگوسیتی مربوط به گونه­های V. odorata و V. alba بود. بررسی فواصل ژنتیکی نی و ترسیم دندروگرام هم نشان داد که این دو گونه کمترین فاصله ژنتیکی را با هم دارند. به طور کلی با توجه به اطلاعات تاکسونومیکی موجود و نتایج به دست آمده از این آزمایش می ­توان گفت که استفاده از نشانگر iPBS کارایی بالایی در مطالعات سیستماتیک جنس Viola دارد. نتایج این آزمایش باعث تفکیک موثر اکوتیپ ­ها و گونه­ ها شد که در مطالعات به­نژادی نیز می­ تواند مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه ها:

Polymorphism ، Genetic distance ، Interspecies analysis ، پلی مورفیسم ، تجزیه و تحلیل های بین گونه ای ، فاصله ژنتیکی

نویسندگان

فرانه روشن

Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Shahrekord University, Shahrekord, Iran

محمد ربیعی

Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Shahrekord University, Shahrekord, Iran

بهروز شیران

Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, Shahrekord University, Shahrekord, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abolghasemi, S., Naderi, R. and Fattahi Moghadam, M. (۲۰۲۰). Evaluation ...
  • Alami, N.H., Smith, R.B., Carrasco, M.A., Williams, L.A., Winborn, C.S., ...
  • Anca, T., Philippe, V., Ilioara, O. and Mircea, T. (۲۰۰۹). ...
  • Apana, N., Amom, T., Tikendra, L., Potshangbam, A.M., Dey, A. ...
  • Babaei, S., Talebi, M., Bahar, M. and Zeinali, H. (۲۰۱۴). ...
  • Beker, K. and Janjic, B. (۲۰۲۰) Violence against women and ...
  • Bennouna, D., Avice, J.-C., Rosique, C., Svilar, L., Pontet, C., ...
  • Braun, M., Esposito, T., Huettel, B. and Harand, A.P. (۲۰۱۹). ...
  • Cheon, K.-S., Kim, K.-A., Kwak, M., Lee, B. and Yoo, ...
  • Dwiningsih, Y. and Alkahtani, J. (۲۰۲۲). Genetics, biochemistry and biophysical ...
  • Elisafenko, T. (۲۰۱۵). Features of seed germination in different ecological ...
  • Gao, Y.-h., Zhu, Y.-Q., Tong, Z.-k., Xu, Z.-y., Jiang, X.-f. ...
  • Gharari, Z., Sharafi, A., Bagheri, K., Yazdinezhad, A. and Bijani, ...
  • Gogoi, L.R., Singh, S.K. and Sarma, R. (۲۰۱۸). Assessment of ...
  • Golkar, P. and Nourbakhsh, V. (۲۰۱۹). Analysis of genetic diversity ...
  • Gorji, A.M., Poczai, P., Polgar, Z. and Taller, J. (۲۰۱۱). ...
  • Haliloğlu, K., Türkoğlu, A., Öztürk, A., Niedbała, G., Niazian, M., ...
  • Haliloğlu, K., Türkoğlu, A., Öztürk, H.I., Özkan, G., Elkoca, E. ...
  • Heo, M.-L. and Jang, Y.-M. (۲۰۲۱). Development and validation of ...
  • Inceer, H., Hayirlioglu-Ayaz, S. and Ozcan, M. (۲۰۰۷). Chromosome numbers ...
  • Jamshidi-Kia, F., Lorigooini, Z. and Amini-Khoei, H. (۲۰۱۷). Medicinal plants: ...
  • Kalendar, R. and Schulman, A.H. (۲۰۱۴). Transposon-based tagging: IRAP, REMAP, ...
  • Khajuria, A.K., Chandra, S., Manhas, R. and Bisht, N. (۲۰۱۹). ...
  • Kizilgeci, F., Bayhan, B., Türkoğlu, A., Haliloglu, K. and Yildirim, ...
  • Kwiatkowska, M., Żabicka, J., Migdałek, G., Żabicki, P., Cubała, M., ...
  • Marcussen, T. (۲۰۰۳). Evolution, phylogeography, and taxonomy within the Viola ...
  • Marcussen, T. (۲۰۰۶). Allozymic variation in the widespread and cultivated ...
  • Marcussen, T., Ballard, H.E., Danihelka, J., Flores, A.R., Nicola, M.V. ...
  • Murray, M. and Thompson, W. (۱۹۸۰). Rapid isolation of high ...
  • Nadeem, M.A., Nawaz, M.A., Shahid, M.Q., Doğan, Y., Comertpay, G., ...
  • Nampy, S. (۲۰۱۹). Induced cleistogamy: A strategy for reproductive assurance ...
  • Nei, M. and Li, W.-H. (۱۹۷۹). Mathematical model for studying ...
  • Peakall, R. and Smouse, P.E. (۲۰۰۶). GENALEX ۶: genetic analysis ...
  • Williams, J.G., Kubelik, A.R., Livak, K.J., Rafalski, J.A. and Tingey, ...
  • Yang, R.-C. and Yeh, F.C. (۱۹۹۲). Genetic consequences of in ...
  • Yockteng, R., Jr Ballard, H., Mansion, G., Dajoz, I. and ...
  • نمایش کامل مراجع