شناسایی کاندید های دارویی جدید آنزیم ترانس کریپتاز معکوس ویروس ایدز در محل جایگاه فعال با غربالگری مجازی مبتنی بر داکینگ مولکولی و مکانیک کوانتومی

سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 86

نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_NBR-11-2_006

تاریخ نمایه سازی: 8 مهر 1403

چکیده مقاله:

ایدز (سندروم نقص ایمنی اکتسابی) یک وضعیت شدید و پیشرفته از عفونت ویروس نقص ایمنی انسانی (HIV) است که باعث ضعف سیستم ایمنی بدن می شود و برای عفونت های فرصت طلب و برخی از انواع سرطان ها پیش زمینه فراهم می کند. چرخه حیاتی HIV  شامل چندین آنزیم است که در تکثیر ویروس نقش دارند. یکی از این آنزیم ها، ترانس کریپتاز معکوس نام دارد. برای مدیریت بهتر درمان، معمولا از ترکیبات درمانی مانند HAART استفاده می شود که از ترکیب چندین دارو تشکیل شده است تا بهبود اثربخشی درمان و کاهش مقاومت دارویی را فراهم آورد. در این مطالعه، با هدف ارزیابی داروهای نویراپین، رالتگراویر، ایندیناویر و کاندید های دارویی جدید در مهار آنزیم ترانس کریپتاز معکوس، ابتدا ساختارهای دارویی به روش های محاسباتی B۳LYP و مجموعه پایه ی ۶-۳۱۱G بهینه سازی شدند و پارامترهای ترمودینامیکی مرتبط با آن ها محاسبه گردید. همه ترکیبات از مجموعه داده و ترکیبات طراحی شده برای پیش بینی ADMET استفاده شدند تا ویژگی های آن ها بررسی شود و همچنین برای ارزیابی داروهای بالقوه استفاده گردد. در پایان، با استفاده از شبیه سازی های داکینگ مولکولی، اثر مهارکنندگی نویراپین، رالتگراویر، ایندیناویر و کاندید های دارویی جدیدNVP۲، RAL۲ وIND۲  با بهترین انرژی بایندینگ -۹.۳۴، -۱۱.۲۸ و -۹.۳۰  بر آنزیم ترانس کریپتاز معکوس مورد ارزیابی قرار گرفت. تحلیل های انجام شده در طول شبیه سازی نشان داد که ترکیبات NVP۲، RAL۲ وIND۲  به خوبی در مهار آنزیم ترانس کریپتاز معکوس ویروس HIV-۱ عمل می کنند.

کلیدواژه ها:

آنزیم ترانس کریپتاز معکوس ، داکینگ مولکولی ، سندروم نقص ایمنی اکتسابی ، طراحی دارو ، م ترانس کریپتاز معکوس ، داکینگ مولکولی ، سندروم نقص ایمنی اکتسابی ، طراحی دارو

نویسندگان

Hanieh Sabaghian

Department of Chemistry, Graduate University of Advanced Technology,Kerman, Iran

Mehdi Yoosefian

Department of Chemistry, Graduate University of Advanced Technology,Kerman, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Ranganathan, K. and Umadevi, K.M.R. ۲۰۱۹. Common oral opportunistic infections ...
  • Vasukutty, A., Pillarisetti, S., Choi, J., Kang, S.H. and Park, ...
  • Jennings, J., Shi, J., Varadarajan, J., Jamieson, P.J. and Aiken, ...
  • Maertens, G.N., Engelman, A.N. and Cherepanov, P. ۲۰۲۲. Structure and ...
  • Badaya, A. and Sasidhar, Y.U. ۲۰۲۰. Inhibition of the activity ...
  • Kim, J.G. and Shan, L. ۲۰۲۲. Beyond inhibition: A novel ...
  • Bertoletti, N., Chan, A.H., Schinazi, R.F., Yin, Y.W. and Anderson, ...
  • Mohammadzadeh, I., Qujeq, D., Yousefi, T., Ferns, G.A., Maniati, M. ...
  • Nastri, B.M., Pagliano, P., Zannella, C., Folliero, V., Masullo, A., ...
  • Achila, O.O., Abrhaley, F., Kesete, Y., Tesfaldet, F., Alazar, F., ...
  • Wang, Y., Wang, A., Wang, J., Wu, X., Sun, Y. ...
  • Torres, B., Guardo, A.C., Squarcia, M., Diaz, A., Fabra, A., ...
  • Tinworth, C.P. and Young, R.J. ۲۰۲۰. Facts, patterns, and principles ...
  • Jha, V., Devkar, S., Gharat, K., Kasbe, S., Matharoo, D.K., ...
  • Apebende, C.G., Ogunwale, G.J., Louis, H., Benjamin, I., Kadiri, M.T., ...
  • Turković, N., ۲۰۲۱. Dizajniranje, sinteza i in vitro ispitivanja derivata ...
  • Chen, T., et al., Algorithm selection for protein–ligand docking: strategies ...
  • نمایش کامل مراجع