مروری بر الگوریتم های همترازی چندگانه توالی های زیستی و رایانش ابری

هم ترازی چندگانه توالی ها۱(MSA) یکی از ضروری ترین تکنیک ها در زمینه بیوانفورماتیک و زیست شناسی محاسباتی است . فناوری های توالی یابی نسل بعدی ، چشم انداز زیست شناسی را تغییر می دهند و پایگاههای اطلاعاتی را با مقادیر عظیمی از دادههای توالی خام پر می کنند. MSA مجموعه دادههای توالی رو به افزایش در حال تبدیل شدن به یک گلوگاه مهم ا ست . به منظور تحقق وعده MSA برای مجموعه دادههای توالی در مقیاس بزرگ، لازم ا ست که الگوریتم های MSA موجود به صورت موازی با دادههای توالی توزیع شده روی یک خوشه محاسباتی یا مزرعه سرور اجرا شوند. بنابراین ترکیب الگوریتم های MSA با فناوری های محاسبات ابری احتمالا سرعت ، کیفیت و توانایی MSA را برای مدیریت تعداد زیادی از توالی ها بهبود می بخشد. در این مقاله ، هم ترازی چندگانه توالی ها با تمرکز ویژه بر روی الگوریتم های ClustalW و Clustal Omega مورد بحث قرار می گیرند. فناوری ها و مفاهیم رایانش ابری تشریح می شوند و نسل بعدی الگوریتم های MSA مبتنی بر ابر معرفی می شوند.

کلیدواژه ها:

رایانش ابری ، بیوانفورماتیک ، همترازی چندگانه توالی ها ، MSA ، سرویس های ابری .