انگشت نگاری گونه های جنس آژیلوپس (Ageilops) با نشانگرهای مبتنی بر ژن های هدفمند و نواحی حفاظت شده CoRAP
سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 66
فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IJRFP-29-2_004
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1403
چکیده مقاله:
گونه های جنس آژیلوپس (Ageilops) از گرامینه های مرتعی و یکی از مهمترین اجداد گندم و منبع غنی از ژنهای تحمل به تنش هاست. بدین منظور انگشت نگاری روابط ژنتیکی توده های متعلق به هشت گونه Ageilopsبا استفاده از نشانگرهای مولکولی CoRAP مبتنی بر ژنهای هدفمند مورد مطالعه قرار گرفت. در طراحی آغازگرهای ثابت از شش ژن عامل تحمل تنش های غیرزیستی CAT، MnSoD، SoS۱، miR۳۹۸، miR۱۶۰b و miR۱۶۹gR استفاده شد. کمترین و بیشترین محتوای اطلاعات چندشکلی بهترتیب مربوط به آغازگرهای CoRAP۲ و CoRAP۱۰ با مقادیر ۹۲/۰ و ۹۶/۰ بود. شاخص نشانگری در بین نشانگرهای مورد بررسی از ۸۹/۶ در آغازگر CoRAP۷ تا ۴۹/۱۳ در آغازگر CoRAP۹ متغیر بود. بین گونه ها جریان ژنی (Nm) پایین و بعکس میزان تمایز (Gst) بالایی مشاهده شد. همچنین مقدار شاخص Fst برابر با ۴۵/۰ نشان داد که جمعیت های مورد مطالعه کاملا از هم متمایز شده اند. با توجه به بالا بودن شاخصهای تعداد آلل موثر و تنوع ژنتیکی Nei، دو گونه Ae. cylandrica و Ae. caudata تنوع درون گونه ای بالایی در بین گونه های مورد بررسی نشان دادند. بیشترین تشابه بین دو گونهAe. truncialis و Ae. umbelulata و بین دو گونه Ae. neglecta و Ae. cylanrica مشاهده شد. تجزیه خوشه ای به طور مناسبی گونه ها را در گروه های مجزا تفکیک و تجزیه به مختصات اصلی نتایج تجزیه خوشه ای را تایید کرد. با تجزیه ساختار جمعیت، نحوه جریان ژنی و اختلاط ژنتیکی بین گونه ها مشخص شد که در تطابق با نتایج تجزیه خوشه ای و نمودار دوبعدی PCoA بود.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
صدیقه فابریکی اورنگ
Assoc. Prof. Department of Genetics & Plant Breeding, Imam Khomeini International University, Qazvin, Iran.
حمید کریمی
M.Sc. of Genetics and Plant Breeding, Imam Khomeini International University, Qazvin, Iran.
جعفر احمدی
Prof., Department of Genetics & Plant Breeding, Imam Khomeini International University, Qazvin, I.R. Iran.
علی اشرف مهرابی
Assoc. Prof. Dept. Biotechnology, Research Institute of Forest and rangelands, Agricultural Research, Education and Extention Organization (AREEO), Tehran, Iran.
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
