ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

شناسایی miRNAهای حفاظت شده و ژن های هدف آنها در گل محمدی (Rosa damascena Mill)

محل انتشار: مجله علمی تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران، دوره: 30، شماره: 2
سال انتشار: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 123

فایل این مقاله در 17 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/2076182

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJRFP-30-2_002

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1403

چکیده مقاله:

ژن­ های (miRNAs)، عناصر تنظیم کننده­ای هستند که نقش اصلی آنها کاهش بیان ژن در سطح mRNAها است. miRNA ها همچنین در چندین مسیر گیاهی مرتبط با فعالیت های مهم سلولی مانند رشد، تکثیر، تمایز، مورفوژنز، آپوپتوزیز و پاسخ به تنش های غیر زیستی و زیستی نقش های مهمی ایفا می کنند. این تحقیق به منظور شناسایی miRNAهای حفاظت شده و ژن­ های هدف آنها با استفاده از داده­ های توالی یابی نسل جدید در گل محمدی (Rosa damascena Mill.) انجام شد. اگرچه روش های بیوانفورماتیک به عنوان کارآمدترین راهبرد برای شناسایی miRNA هدف توسعه یافته اند، راهبرد های آزمایشی با کارایی بالا هنوز بسیار مورد تقاضا هستند. برای شناسایی miRNAهای جدید، پیش بینی و تعیین هستی­ شناسی ژن های هدف درگیر در مسیر تولید رایحه و رنگ در گل محمدی به ترتیب از ابزارهای بیوانفورماتیکی Cmii، psRNATarget، WEGOو Blast۲GO به ­علاوه روش آزمایشگاهی (Real-time PCR) استفاده شد. با استفاده از داده های EST و RNA-seq مبتنی بر همولوژی گیاه Rosa lucieae در نهایت چهار خانواده miRNA، شامل: miR۵۰۲۱، miR۲۶۷۳، miR۱۵۶ و miR۸۳۸ به عنوان miRNAهای نامزد انتخاب شدند. در مرحله بعد برای ارزیابی کمی Real-time PCR برای اعتبارسنجی سطح بیان miR۵۰۲۱ منتخب در دو نمونه (سفید و صورتی) و مرحله بیولوژیکی (جوان و غنچه) گل محمدی، محلول پاشی با غلظت­ های صفر (شاهد) و ۳۰۰ میکرومولار متیل ­جاسمونات به مدت ۴۸ ساعت بیشترین بیان نسبی   miR۵۰۲۱ متعلق به نمونه صورتی رنگ را در مرحله نموی جوان نشان داد. این یافته ها مطالعات چشم انداز آینده را در مورد سازوکارهای تنظیمی miRNAها درRosa damascena سرعت می بخشد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

هدی سادات کیانی

Ph.D. Student, Dept. Agriculture and Plant Breeding, Faculty of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj, I.R. Iran.

منیژه سبکدست نودهی

Assist. Prof., Dept. Agriculture and Plant Breeding, Faculty of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj, I.R. Iran.

محمد رضا نقوی

Prof., Dept. Agriculture and Plant Breeding, Faculty of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj, I.R. Iran.

مجید شکرپور

Assoc. Prof., Dept. Agriculture and Plant Breeding, School of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj, I.R. Iran.

نجمه یزدانفر

Assist. Prof., Chemical Industries Development Research Institute, Karaj, I.R. Iran.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Ahmad, A., Khan, H. A., & Kazmi, M. N. A. ...
  • Akhtar, G., Jaskani, M. J., Farooq, A., Byrne, D. H., ...
  • Arif, M. A., Top, O., Csicsely, E., Lichtenstern, M., Beheshti, ...
  • Baydar, H., ERBAŞ, S., & Kazaz, S. ۲۰۱۶. Variations in ...
  • Bendahmane, M., Dubois, A., Raymond, O., & Bris, M. L. ...
  • Biswas, S., Hazra, S., & Chattopadhyay, S. ۲۰۲۲. Deep sequencing ...
  • Bolger, A. M., Lohse, M., & Usadel, B. ۲۰۱۴. Trimmomatic: ...
  • Bonnet, E., Wuyts, J., Rouzé, P., & Van de Peer, ...
  • Cai, Y., Yu, X., Hu, S., & Yu, J. ۲۰۰۹. ...
  • Chang, L., & Xia, J. ۲۰۲۳. MicroRNA Regulatory Network Analysis ...
  • Dai, X., & Zhao, P. X. ۲۰۱۱. psRNATarget: a plant ...
  • de Sena Brandine, G., & Smith, A. D. ۲۰۱۹. Falco: ...
  • Devi, K. J., Saha, P., Chakraborty, S., & Rajwanshi, R. ...
  • Fan, R., Li, Y., Li, C., & Zhang, Y. ۲۰۱۵. ...
  • Fooladvand, Z., & Fazelinasab, B. ۲۰۱۶. Study the genomes expressed ...
  • Glagoleva, A. Y., Vikhorev, A. V., Shmakov, N. A., Morozov, ...
  • Ha, M., & Kim, V. N. ۲۰۱۴. Regulation of microRNA ...
  • Huang, X., & Madan, A. ۱۹۹۹. CAP۳: A DNA sequence ...
  • Identification of miRNAs and Their Target Genes in Taraxacum spp [مقاله ژورنالی]
  • Karimi, A. A., Naghavi, M., & Nasiri, J. ۲۰۱۸. Identification ...
  • Karimi, L., Mansoori, B., Mohammadi, A., Aghapour, M., & Baradaran, ...
  • Khosh-Khui, M. ۲۰۱۴. Biotechnology of scented roses: a review. International Journal ...
  • Li, P., Tian, Z., Zhang, Q., Zhang, Y., Wang, M., ...
  • Li, Y., Zhao, H., Wilkins, K., Hughes, C., & Damon, ...
  • Ma, C., Zhou, D., Wang, H., Han, D., Wang, Y., ...
  • Mallory, A. C., & Vaucheret, H. ۲۰۰۶. Functions of microRNAs ...
  • Mehta, R., Otgonsuren, M., Younoszai, Z., Allawi, H., Raybuck, B., ...
  • Modi, A., Purohit, P., Gadwal, A., Ukey, S., Roy, D., ...
  • Naghavi, M. R., & Karimi, A. A. ۲۰۱۸. Identification of ...
  • Najafabadi, A. S., & Naghavi, M. R. ۲۰۱۸. Mining Ferula ...
  • Nouri Jahangirloo, A. M. ۲۰۱۷. Identify and evaluation of miRNA and ...
  • Numnark, S., Mhuantong, W., Ingsriswang, S., & Wichadakul, D. ۲۰۱۲, ...
  • Nurmohammadi, N., Esmaili, A., Sobhani Najafabadi, A. & Nazarian Firouzabadi, ...
  • Owusu Adjei, M., Zhou, X., Mao, M., Rafique, F., & ...
  • Park, W., Li, J., Song, R., Messing, J., & Chen, ...
  • Pfaffl, M. W., Horgan, G. W., & Dempfle, L. ۲۰۰۲. ...
  • Rasouli, O., Ahmadi, N., & Monfared, S. R. ۲۰۲۰. Molecular ...
  • Rasouli, O., Ahmadi, N., Monfared, S. R., & Sefidkon, F. ...
  • Sabzehzari, M., & Naghavi, M. R. ۲۰۱۹. Phyto-miRNA: a molecule ...
  • Salimi, Shekari, & Farid. ۲۰۱۲. Effect of methyl jasmonate and ...
  • Samad, A. F., Sajad, M., Nazaruddin, N., Fauzi, I. A., ...
  • Samandari-Bahraseman, M. R., Ismaili, A., Esmaeili-Mahani, S., Ebrahimie, E., & ...
  • Samavatian, H., Soltani, B. M., Yousefi, F., Jashni, M. K., ...
  • Sewe, S. O., Silva, G., Sicat, P., Seal, S. E., ...
  • Shen, J., Deng, Y., Jin, X., Ping, Q., Su, Z., ...
  • Singh, N., Srivastava, S., Shasany, A. K., & Sharma, A. ...
  • Smith-Unna, R., Boursnell, C., Patro, R., Hibberd, J. M., & ...
  • Tian, T., Wang, J., & Zhou, X. ۲۰۱۵. A review: ...
  • Varkonyi-Gasic, E., Wu, R., Wood, M., Walton, E. F., & ...
  • Wang, J., Lewis, D., Shi, R., McGhie, T., Wang, L., ...
  • Wang, J., Mei, J., & Ren, G. ۲۰۱۹. Plant microRNAs: ...
  • Wasternack, C., & Hause, B. ۲۰۱۳. Jasmonates: biosynthesis, perception, signal ...
  • Wei, R., Qiu, D., Wilson, I. W., Zhao, H., Lu, ...
  • Yang, J., Zhang, F., Li, J., Chen, J. P., & ...
  • Yang, J., Zhang, N., Ma, C., Qu, Y., Si, H., ...
  • Yuan, J., Chao, Y., & Han, L. ۲۰۲۲. Uncovering a ...
  • Zhang, B. H., Pan, X. P., Cox, S. B., Cobb, ...
  • Zhang, B., & Wang, Q. ۲۰۱۵. MicroRNA‐based biotechnology for plant ...
  • Zhang, G., Wang, H., Zhang, Z., Verstrepen, K. J., Wang, ...
    • نمایش کامل مراجع