ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

توسعه نشانگرهای مولکولی EST-SSR مرتبط با مسیرهای متابولیکی در گیاه کرفس کوهی

محل انتشار: دوفصلنامه مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی، دوره: 12، شماره: 2
سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 63

فایل این مقاله در 15 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/2071164

شناسه ملی سند علمی:

JR_GEB-12-2_014

تاریخ نمایه سازی: 24 شهریور 1403

چکیده مقاله:

کرفس کوهی (Kelussia odoratissima Mozaff) یکی از مهم ترین گیاهان دارویی و در معرض انقراض ایران است. کرفس کوهی نه تنها به عنوان یک سبزی ارزشمند به صورت خام مورد استفاده قرار می گیرد، بلکه دارای خواص درمانی بسیاری هم در طب سنتی و هم در ترکیبات داروهای گیاهی مدرن از منظر فارماکولوژیکی است. فقدان اطلاعات تنوع ژنتیکی و همچنین عدم شناخت ساز وکار تولید متابولیت های مهم در این گیاه، تحقیقات ژنتیکی پیرامون این گیاه را با چالش مواجهه کرده است. در پژوهش حاضر، با هدف توسعه نشانگر­های EST-SSR در مقیاس بالا، از فرآیند سرهم­بندی نوپدید خوانش­های کوتاه حاصل از فناوری توالی­یابی نسل جدید استفاده شد. تعداد ۷۵۷۵ مکان ریزماهواره در ۶۳۸۸ یونی­ژن در ترنسکریپتوم کرفس کوهی شناسایی شد. در میان این نشانگرها، موتیف­های دو نوکلئوتیدی و پس از آن تک و سه نوکلئوتیدی بالاترین فراوانی را نشان دادند. نتایج بلاست رونوشت های حاوی ریزماهواره نشان داد که ۷۴/۷۹ درصد از رونوشت­ها دارای حداقل یک رکورد در پایگاه پروتئین های غیرتکراری بودند. جستجوی عوامل رونویسی، تفسیر کارکردی و همچنین مستندسازی رونوشت­ها در برابر پایگاه KEGG، اکثر یونی­ژن­های حاوی ریزماهواره را در مسیر­های متابولیکی و بیوسنتز متابولیت های ثانویه دخیل دانست. نتایج حاصل نشان داد که این نشانگرها به تحلیل تنوع ژنتیکی و مسیرهای متابولیکی این گیاه کمک می کنند، اطلاعاتی که می تواند در حفظ و بهره برداری پایدار از این گیاه با اهمیت تلقی شوند.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

مریم رمضانی

Department of Plant Production and Genetic Engineering, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran.

فرهاد نظریان فیروزآبادی

Department of Plant Production and Genetic Engineering, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran.

احمد اسماعیلی

Department of Plant Production and Genetic Engineering, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran.

سید سجاد سهرابی

Department of Plant Production and Genetic Engineering, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Ahmadi, F., Kadivar, M., & Shahedi, M. (۲۰۰۷). Antioxidant activity ...
  • Ahmadi, K., Omidi, H., Amini Dehaghi, M., & Naghdi Badi, ...
  • Ahmadi, K., Omidi, H., Amini Dehaghi, M., & Soltani, E. ...
  • Akbarian, A., Rahimmalek, M., Sabzalian, M. R., & Sarfaraz, D. ...
  • Akkafi, H. R., Valivand, M., & Jenabi, T. (۲۰۱۴). Autecological, ...
  • Altschul, S. F., Madden, T. L., Schäffer, A. A., Zhang, ...
  • Ashengroph, M., & Nahvi, I. (۲۰۱۴). Biological Production of Natural ...
  • Chang, S., Li, Q., Huang, B., Chen, W., & Tan, ...
  • Chen, J., Li, R., Xia, Y., Bai, G., Guo, P., ...
  • Czerniawski, P., & Bednarek, P. (۲۰۱۸). Glutathione S-Transferases in the ...
  • Dai, Y., Su, W., Yang, C., Song, B., Li, Y., ...
  • Di, P., Wang, P., Yan, M., Han, P., Huang, X., ...
  • Dixon, D. P., Skipsey, M., & Edwards, R. (۲۰۱۰). Roles ...
  • Durand, J., Bodénès, C., Chancerel, E., Frigerio, J.M., Vendramin, G., ...
  • Dutta, H., Mishra, G. P., Aski, M. S., Bosamia, T. ...
  • Fernandes, L. M. P., Bezerra, F. R., Monteiro, M. C., ...
  • Gostimsky, S. A., Kokaeva, Z. G., & Konovalov, F. A. ...
  • Grandi, E., Crotti, M., Sigmund, M. C., Xu, G., Tepper, ...
  • Guo, A. Y., Chen, X., Gao, G., Zhang, H., Zhu, ...
  • Gupta, D. S., Cheng, P., Sablok, G., Thavarajah, P., Coyne, ...
  • Hasan, N., Choudhary, S., Naaz, N., Sharma, N., & Laskar, ...
  • Javani, R., & Asadi-Gharneh, H. A. (۲۰۲۰). Mineral composition in ...
  • Kaur, S., Cogan, N. O., Pembleton, L. W., Shinozuka, M., ...
  • Khadijeh, A., Heshmat, O., Majid, A. D., & Hasanali, N. ...
  • Kuang, X., Du, J. R., Liu, Y. X., Zhang, G. ...
  • Li, D., Deng, Z., Qin, B., Liu, X., & Men, ...
  • Majdi, M., Karimzadeh, G., & Malboobi, M. (۲۰۱۴). Spatial and ...
  • Mezgebu Legesse, H., & Etsegenet Assefa, B. (۲۰۲۰). Biological Application ...
  • Mirzaei, F., Norouzi, R., Siyadatpanah, A., Mitsuwan, W., Nilforoushzadeh, M., ...
  • Niksiar, P., Navvabpour, S., Sabouri, H., Soltanlu, H. & Rahimi, ...
  • Patra, B., Schluttenhofer, C., Wu, Y., Pattanaik, S., & Yuan, ...
  • Peng, J., Shi, C., Wang, D., Li, S., Zhao, X., ...
  • Powell, W., Machray, G. C., & Provan, J. (۱۹۹۶). Polymorphism ...
  • Ren, Q., Liu, X. Q., Zhou, X. W., Zhou, X., ...
  • Saina, J. K., Li, Z. Z., Mekbib, Y., Gichira, A. ...
  • Samandari-Bahraseman, M. R., Ismaili, A., Esmaeili-Mahan, S., Ebrahimie, E., & ...
  • Schluttenhofer, C., & Yuan, L. (۲۰۱۷). Challenges towards Revitalizing Hemp: ...
  • Shen, W., Li, H., Teng, R., Wang, Y., Wang, W., ...
  • Smith-Unna, R., Boursnell, C., Patro, R., Hibberd, J. M., & ...
  • Sohrabi, S. S., Ismaili, A., Azarian Firouz-Abadi, F. N., & ...
  • Song, Z. H., Ji, Z. N., Lo, C. K., Dong, ...
  • Sudheesh, S., Verma, P., Forster, J. W., Cogan, N. O., ...
  • Taheri, S., Abdullah, T. L., Rafii, M. Y., Harikrishna, J. ...
  • Tanksley, S. D. (۱۹۸۳). Molecular markers in plant breeding. Plant ...
  • Torki, A., Hosseinabadi, T., Fasihzadeh, S., Sadeghimanesh, A., Wibowo, J. ...
  • Wang, P., Yang, L., Zhang, E., Qin, Z., Wang, H., ...
  • Wang, Z., Li, J., Luo, Z., Huang, L., Chen, X., ...
  • Wei, W., Qi, X., Wang, L., Zhang, Y., Hua, W., ...
  • Wu, Q., Bai, X., Zhao, W., Shi, X., Xiang, D., ...
  • Xu, L., Li, P., Su, J., Wang, D., Kuang, Y., ...
  • Yang, C. Q., Fang, X., Wu, X. M., Mao, Y. ...
  • Yin, J., Ren, W., Huang, X., Deng, J., Li, T., ...
  • Zhang, X., Luo, H., Xu, Z., Zhu, Y., Ji, A., ...
  • Zheng, H., Yu, M. Y., Han, Y., Tai, B., Ni, ...
    • نمایش کامل مراجع