بررسی بیوانفورماتیکی اثر ژن PFT1 در بیان ژن های دفاعی گیاه آرابیدوپسیس

آزمایشات میکرواری با دید مطالعه ترانسکرپتوم منجر به شناسایی اثرات متقابل مولکول ها، ژ نها و ترکیبات مختلف درون سلولی شده است. رسم شبکه مجموعه ارتباطات مولکولی و کشف اجتماع ترکیبات مختلف در یک فرایند بیولوژیک از مزایای اصلی آزمایشات میکرواری است و به شناسایی ژن ها، پروتئی نها، متابولیت ها و ترکیباتی می پردازد که در یک یا چندین مسیر خاص درگیرند. بدون شک تشخیص اینگونه ارتباطات پیچیده ژنی در ابعاد مولکولی کلید حل بسیاری از معماها درمقاومت به تنش های زنده و غیر زنده و دیگر ویژگی ها می باشد. هورمون های مرتبط با دفاع (جاسمونات) ، شبکه سیگنالینگ دفاع گیاه را از طریق فعال کردن فاکتورهای رونویسی هماهنگ و موزون می کنند. تنظیم رونویسی و بیان ژ نهای دفاعی نقش عمده ای در تعیین میزان مقاومت در برابر پاتوژن ها دارد. ژن PFT1 Phytochrome and flowering time1 که زیر واحد Mediator25 ز کمپلکس واسطه را کد می کند، برای بیان ژن دفاع وابسته به جاسمونات و نکروز شدن برگ های آلوده شده به پاتوژن های قارچی نیاز است. در گیاه موتانت PFT1 کمپلکس واسطه که برای بیان ژن های دفاعی پاسخ به جاسمونات لازم است حذف شده و گیاه را مستعد بیماری می کند. در این مطالعه با کمک نرم افزار Pathway studio به بررسی اثر ژن PFT1 درشبکه ژنی آرابیدوپسیس پرداخته شده و سپس عملکرد هر یک از ژن های موجود مورد بررسی قرار گرفته است.

کلیدواژه ها:

آزمایشات میکرواری ، سیگنالینگ جاسمونات ، ژن PFT1 کمپلکس واسطه ، نرم افزار Pathway studio دفاع گیاه