مقایسه طبقهبندی و فیلوژنی دو جنس باکتریایی Clavibacter و Rathayibacter با استفاده از آنالیز توالی برخی ژنها

تحلیل توالیهای حاصل از برخی ژنها که به عنوان ژنهای حفاظت شده معرفی شدهاند میتواند در تشخیص و طبقهبندی فیلوژنتیکی باکتریها به کار رود. جنس Rathayibacter در گذشته جزو جنس Clavibacter بوده که اولین بار بر اساس آنالیز توالی حاصل از ژن srDNA16 از این جنس جدا شده است. در این پژوهش توالی برخی از ژنهای حفاظت شده از جمله rRNA s16 و فاصلهی بینژنومی ITS و توالی ژنومی آنزیمهای رکومبیناز RNA پلیمراز و DNA جیراز در تعدادی از گونههای باکتریهای Clavibacter و Rathayibacter از بانکهای اطلاعاتی استخراج و توسط نرمافزار MEGA5 بوسیلهی روش neighbor joining خوشهبندی شدند. از ارزیابی دندروگرامهای حاصل به نظر میرسد که همهی ژن ها بجز ITS بخوبی این دو جنس را از یکدیگر تفکیک میکنند.

کلیدواژه ها:

آنالیز فیلوژنتیکی ، ژنهای حفاظت شده ، Rathayibacter ، Clavibacter