مطالعه بیوانفورماتیکی ژن Catalase در چند گیاه مختلف

کاتالاز به عنوان یکی از مهمترین آنزیم های آنتی اکسیدانی است که با تجزیه H۲O۲ به تعادل گونه های اکسیژن فعال کمک کرده و نقش مهمی در در گیاهان در مقابل تنش اکسیداتیو به عهده دارد . در این پژوهش به منظور بررسی و مطالعه ژن کاتالاز، توالی ژنومی ژن کاتالاز در چندین نمونه گیاهی مختلف (آرابیدوپسیس تالیانا ، آرابیدوپسیس لیراتا ، برنج ، گندم ، جو ، ذرت ، کلزا ، کلم راپا ، کلم برگ ، سویا ، ماش ،پنبه ، کرچک ، کنجد ، بادام زمینی ) از سایت NCBI استخراج و مورد بررسی قرار گرفت . نتایج بیانگر این بود که طول ژن کاتالاز از ۴۴۹۶- ۲۸۳۷جفت نوکلئوتید در گیاهان مورد بررسی متغییر بوده است . نتایج هم ردیفی نشان داد که توالی نوکلئوتیدی ژن Cat در گونه های مورد مطالعه دارای بیش از ۷۵ درصد شباهت و توالی اسیدآمینه آنها دارای بیش از ۸۶ درصد شباهت می باشد. نقطه ایزوالکتریک بین ۰۸,۷- ۶۴۳/ ۶ متغییر بود و این پروتئین با فراوانی بالا در ناحیه پراکسیزوم قرار دارد. ترسیم درخت فیلوژنتیکی نیز حاکی از قرار گیری گیاهان مورد مطالعه در دو گروه مجزا بود.

کلیدواژه ها:

کاتالاز ، آنتی اکسیدان ، هم ردیفی و تنش اکسیداتیو